More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2408 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  100 
 
 		 606 aa  1191    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.5 
 
 		 603 aa  617  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
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NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.98 
 
 		 589 aa  536  1e-151  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.91 
 
 		 579 aa  527  1e-148  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  42.32 
 
 		 584 aa  526  1e-148  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.49 
 
 		 594 aa  520  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.69 
 
 		 610 aa  519  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
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NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.16 
 
 		 626 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  46.35 
 
 		 594 aa  491  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.88 
 
 		 594 aa  485  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.96 
 
 		 633 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
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NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.72 
 
 		 594 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.53 
 
 		 613 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.36 
 
 		 613 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.75 
 
 		 603 aa  480  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.53 
 
 		 600 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.78 
 
 		 603 aa  478  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
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NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.31 
 
 		 619 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
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NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.87 
 
 		 603 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.53 
 
 		 600 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
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NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.97 
 
 		 613 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
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NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  47.27 
 
 		 585 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.22 
 
 		 594 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  46.1 
 
 		 613 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.22 
 
 		 605 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
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NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  44.39 
 
 		 600 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.18 
 
 		 573 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  46.37 
 
 		 613 aa  465  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.38 
 
 		 613 aa  464  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.99 
 
 		 611 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.86 
 
 		 575 aa  464  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.82 
 
 		 611 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.26 
 
 		 605 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.79 
 
 		 582 aa  457  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
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NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  48.98 
 
 		 583 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.81 
 
 		 583 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.82 
 
 		 611 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.907848 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.4 
 
 		 583 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
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NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.98 
 
 		 597 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.34 
 
 		 580 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.87 
 
 		 588 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.07 
 
 		 597 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
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NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.59 
 
 		 577 aa  437  1e-121  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.86 
 
 		 588 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.858016 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  43.03 
 
 		 592 aa  428  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.93 
 
 		 600 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.09 
 
 		 811 aa  350  6e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.33 
 
 		 827 aa  347  5e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.69 
 
 		 574 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.96 
 
 		 989 aa  344  2e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41 
 
 		 599 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.63 
 
 		 977 aa  339  8e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.48 
 
 		 586 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.95 
 
 		 885 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.52 
 
 		 907 aa  332  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.54 
 
 		 573 aa  330  7e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.87 
 
 		 568 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.75 
 
 		 584 aa  328  2.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.03 
 
 		 573 aa  324  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.86 
 
 		 573 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.49 
 
 		 564 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.34 
 
 		 578 aa  317  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.81 
 
 		 814 aa  317  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.64 
 
 		 574 aa  314  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.64 
 
 		 574 aa  313  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_3376  exonuclease RecJ  40.6 
 
 		 569 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.593595 
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.14 
 
 		 574 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.76 
 
 		 570 aa  310  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  32.47 
 
 		 566 aa  310  4e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.46 
 
 		 801 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.97 
 
 		 955 aa  310  6.999999999999999e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  38.79 
 
 		 571 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.59 
 
 		 570 aa  307  4.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.78 
 
 		 568 aa  306  5.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.13 
 
 		 578 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.24 
 
 		 955 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.08 
 
 		 1035 aa  303  4.0000000000000003e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  37.67 
 
 		 578 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.97 
 
 		 569 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0772  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.93 
 
 		 574 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167693  hitchhiker  0.00446395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.66 
 
 		 584 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  34.36 
 
 		 932 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  37.59 
 
 		 577 aa  301  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  34.19 
 
 		 568 aa  301  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.54 
 
 		 576 aa  301  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.08 
 
 		 773 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  37.39 
 
 		 577 aa  299  8e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.61 
 
 		 571 aa  299  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.21 
 
 		 577 aa  299  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  37.21 
 
 		 577 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1819  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.34 
 
 		 577 aa  299  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  37.39 
 
 		 577 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  37.21 
 
 		 577 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  37.21 
 
 		 577 aa  298  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  37.39 
 
 		 577 aa  298  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  37.39 
 
 		 577 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  37.21 
 
 		 577 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  37.39 
 
 		 577 aa  297  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.19 
 
 		 798 aa  298  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  37.21 
 
 		 577 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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