More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0674 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 583 aa  1187    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.5 
 
 		 907 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.64 
 
 		 785 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.51 
 
 		 788 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.19 
 
 		 811 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.26 
 
 		 773 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.64 
 
 		 779 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.89 
 
 		 573 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.64 
 
 		 779 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.61 
 
 		 779 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.26 
 
 		 779 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.98 
 
 		 885 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.57 
 
 		 779 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.43 
 
 		 779 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.26 
 
 		 779 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.92 
 
 		 827 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  38.43 
 
 		 779 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  38.11 
 
 		 779 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.11 
 
 		 779 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  38.46 
 
 		 932 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.52 
 
 		 831 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.13 
 
 		 814 aa  360  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.11 
 
 		 578 aa  360  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.07 
 
 		 573 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  36.77 
 
 		 578 aa  352  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.2 
 
 		 798 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.68 
 
 		 573 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.72 
 
 		 574 aa  350  3e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.25 
 
 		 584 aa  351  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.5 
 
 		 573 aa  350  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.71 
 
 		 599 aa  350  6e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.1 
 
 		 584 aa  349  9e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  33.68 
 
 		 574 aa  348  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.74 
 
 		 570 aa  346  6e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.43 
 
 		 564 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.39 
 
 		 568 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.46 
 
 		 578 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.56 
 
 		 574 aa  340  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.72 
 
 		 571 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.1 
 
 		 568 aa  337  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_008751  Dvul_2080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.73 
 
 		 580 aa  336  9e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0780382 
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.26 
 
 		 572 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.4 
 
 		 801 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  35.17 
 
 		 742 aa  334  3e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.45 
 
 		 587 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.98 
 
 		 586 aa  330  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.91 
 
 		 569 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  33.69 
 
 		 655 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.43 
 
 		 579 aa  327  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  34.95 
 
 		 592 aa  327  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.57 
 
 		 864 aa  326  9e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.1 
 
 		 572 aa  325  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.72 
 
 		 573 aa  324  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
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NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.99 
 
 		 911 aa  323  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  32.98 
 
 		 568 aa  323  6e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.68 
 
 		 570 aa  323  6e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.15 
 
 		 654 aa  323  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.86 
 
 		 570 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.29 
 
 		 567 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.16 
 
 		 568 aa  321  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  34.48 
 
 		 568 aa  320  6e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.45 
 
 		 955 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.79 
 
 		 732 aa  319  7.999999999999999e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.74 
 
 		 757 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.74 
 
 		 757 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.26 
 
 		 955 aa  318  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
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NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  32.9 
 
 		 756 aa  317  3e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
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NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.9 
 
 		 857 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.53 
 
 		 571 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2715  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.46 
 
 		 568 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.036762  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.45 
 
 		 883 aa  313  6.999999999999999e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013171  Apre_0909  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.92 
 
 		 576 aa  312  9e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.18 
 
 		 1102 aa  310  5e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0138959 
 
 
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NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.79 
 
 		 592 aa  310  5.9999999999999995e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.53 
 
 		 655 aa  309  8e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.53 
 
 		 655 aa  309  8e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.18 
 
 		 592 aa  309  9e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.61 
 
 		 568 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.15 
 
 		 1035 aa  307  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  32.33 
 
 		 566 aa  306  6e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_011898  Ccel_1953  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.79 
 
 		 576 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.03 
 
 		 574 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_008312  Tery_4190  exonuclease RecJ  32.72 
 
 		 701 aa  305  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 		 573 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_1070  single-stranded DNA-specific exonuclease  33.98 
 
 		 622 aa  305  2.0000000000000002e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.76 
 
 		 579 aa  303  4.0000000000000003e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  34.41 
 
 		 684 aa  303  4.0000000000000003e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.94 
 
 		 865 aa  302  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.45 
 
 		 566 aa  300  4e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.06 
 
 		 564 aa  300  6e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.47 
 
 		 566 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.09 
 
 		 573 aa  297  3e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0292  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.52 
 
 		 577 aa  297  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013170  Ccur_04000  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.39 
 
 		 1134 aa  296  5e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.544211 
 
 
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NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  32.38 
 
 		 736 aa  295  1e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.81 
 
 		 757 aa  294  3e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.62 
 
 		 977 aa  294  3e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002620  TC0732  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.69 
 
 		 582 aa  293  4e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.213373  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_1602  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.75 
 
 		 823 aa  293  5e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
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NC_014248  Aazo_3592  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.15 
 
 		 696 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.800679  n/a   
 
 
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