More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3712 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  59.51 
 
 		 577 aa  701    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.34 
 
 		 577 aa  699    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0845  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.61 
 
 		 577 aa  656    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  59.37 
 
 		 577 aa  697    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0892  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.79 
 
 		 584 aa  658    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.488933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4094  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.97 
 
 		 584 aa  681    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  58.57 
 
 		 577 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0952  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.94 
 
 		 574 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  59.34 
 
 		 577 aa  698    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1993  ssDNA exonuclease RecJ  57.74 
 
 		 584 aa  679    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3522  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.79 
 
 		 577 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.39 
 
 		 576 aa  683    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  54.51 
 
 		 571 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  58.74 
 
 		 577 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0897  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.47 
 
 		 574 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.52 
 
 		 580 aa  668    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2737  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.24 
 
 		 574 aa  665    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3302  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.71 
 
 		 572 aa  645    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.117483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  59.34 
 
 		 577 aa  699    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.57 
 
 		 574 aa  663    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  59.34 
 
 		 577 aa  697    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  58.81 
 
 		 577 aa  693    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03407  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  60.49 
 
 		 573 aa  694    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  59.16 
 
 		 577 aa  698    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  58.67 
 
 		 577 aa  703    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  59.34 
 
 		 577 aa  699    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.54 
 
 		 579 aa  662    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  58.84 
 
 		 577 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3447  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.14 
 
 		 574 aa  660    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0749  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.16 
 
 		 574 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0015193  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0772  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.44 
 
 		 574 aa  656    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167693  hitchhiker  0.00446395 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  58.57 
 
 		 577 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0647  ssDNA exonuclease RecJ  56.21 
 
 		 584 aa  644    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.252802  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0564  ssDNA exonuclease RecJ  56.57 
 
 		 579 aa  660    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.755584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 572 aa  1169    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  56.54 
 
 		 579 aa  662    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0895  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.12 
 
 		 574 aa  657    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3641  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.97 
 
 		 577 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.94 
 
 		 574 aa  656    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3226  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.94 
 
 		 574 aa  657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0665  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.99 
 
 		 574 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0729862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  58.84 
 
 		 577 aa  704    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.333614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.6 
 
 		 571 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.77 
 
 		 571 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3310  ssDNA exonuclease RecJ  58.04 
 
 		 577 aa  671    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.24828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0863  ssDNA exonuclease RecJ  56.45 
 
 		 584 aa  653    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  58.57 
 
 		 577 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  59.51 
 
 		 577 aa  701    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_3329  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.94 
 
 		 574 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  58.57 
 
 		 577 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_3760  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.91 
 
 		 610 aa  632  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.671236 
 
 
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NC_009439  Pmen_3376  exonuclease RecJ  54.37 
 
 		 569 aa  631  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.593595 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.98 
 
 		 569 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006368  lpp1417  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.75 
 
 		 579 aa  629  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006369  lpl1567  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.1 
 
 		 579 aa  629  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_39440  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.2 
 
 		 569 aa  628  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.31407  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.96 
 
 		 569 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  54.89 
 
 		 574 aa  621  1e-177  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  55.65 
 
 		 581 aa  622  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.68 
 
 		 569 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.71 
 
 		 574 aa  619  1e-176  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.86 
 
 		 569 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.42 
 
 		 569 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1474  single-strand DNA-specific exonuclease  54.64 
 
 		 573 aa  617  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  52.97 
 
 		 569 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2272  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.44 
 
 		 577 aa  578  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1819  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.33 
 
 		 577 aa  569  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  1 
 
 
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NC_007484  Noc_1189  RecJ exonuclease  52.09 
 
 		 574 aa  561  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_1460  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.41 
 
 		 574 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  50.54 
 
 		 566 aa  539  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0150  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.11 
 
 		 575 aa  515  1e-144  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.111864  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0628  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.99 
 
 		 599 aa  511  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  49.02 
 
 		 566 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.09 
 
 		 563 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2758  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.76 
 
 		 574 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  48.64 
 
 		 565 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2026  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.09 
 
 		 565 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1154  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.09 
 
 		 565 aa  491  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2153  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.09 
 
 		 565 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000147893  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1771  exonuclease RecJ  48.01 
 
 		 565 aa  486  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.722264 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0640  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.21 
 
 		 613 aa  487  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2065  exonuclease RecJ  49.91 
 
 		 564 aa  488  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1448  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.77 
 
 		 577 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.94 
 
 		 574 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1817  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.49 
 
 		 585 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0771206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease protein  50.27 
 
 		 565 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00151931  normal  0.274168 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1470  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.9 
 
 		 586 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5422  RecJ exonuclease  49.64 
 
 		 565 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0790  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.69 
 
 		 611 aa  480  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_3702  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.49 
 
 		 571 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713364 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.28 
 
 		 565 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
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NC_010002  Daci_5406  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.97 
 
 		 572 aa  478  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5961  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.28 
 
 		 565 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2116  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.28 
 
 		 565 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.457344  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_0958  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.09 
 
 		 564 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.388256  normal  0.0147257 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1564  RecJ exonuclease  48.25 
 
 		 568 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373395  normal  0.277595 
 
 
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NC_007204  Psyc_0733  exonuclease RecJ  44.3 
 
 		 608 aa  472  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010531  Pnec_0487  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.19 
 
 		 601 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.624528  normal  1 
 
 
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NC_007969  Pcryo_0720  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.35 
 
 		 608 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.678408  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49 
 
 		 564 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497812  normal  0.288787 
 
 
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