More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2743 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 574 aa  1162    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.55 
 
 		 571 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008751  Dvul_2080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.45 
 
 		 580 aa  519  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0780382 
 
 
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NC_013223  Dret_0292  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.74 
 
 		 577 aa  504  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2715  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.83 
 
 		 568 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.036762  n/a   
 
 
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NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.12 
 
 		 578 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.88 
 
 		 599 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.13 
 
 		 573 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.4 
 
 		 586 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.96 
 
 		 578 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.96 
 
 		 568 aa  372  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.07 
 
 		 885 aa  359  8e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.15 
 
 		 907 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  39.3 
 
 		 578 aa  355  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.95 
 
 		 831 aa  354  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.18 
 
 		 814 aa  352  7e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.72 
 
 		 583 aa  350  3e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.13 
 
 		 573 aa  349  8e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.42 
 
 		 564 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.19 
 
 		 827 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.95 
 
 		 573 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.53 
 
 		 798 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.76 
 
 		 811 aa  336  7e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  37.31 
 
 		 684 aa  335  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.35 
 
 		 572 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  33.33 
 
 		 574 aa  330  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.05 
 
 		 655 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.05 
 
 		 655 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.85 
 
 		 568 aa  329  9e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 		 572 aa  329  9e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.81 
 
 		 570 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.98 
 
 		 566 aa  326  8.000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.92 
 
 		 566 aa  323  4e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.86 
 
 		 570 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.45 
 
 		 569 aa  320  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.95 
 
 		 584 aa  319  7e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  37.52 
 
 		 932 aa  319  7.999999999999999e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  38.54 
 
 		 577 aa  319  9e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.41 
 
 		 587 aa  318  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  36.85 
 
 		 592 aa  318  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.96 
 
 		 773 aa  317  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  36.52 
 
 		 571 aa  317  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.61 
 
 		 779 aa  316  6e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.61 
 
 		 779 aa  316  6e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.01 
 
 		 574 aa  316  7e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.45 
 
 		 573 aa  314  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  35.1 
 
 		 566 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.92 
 
 		 788 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.61 
 
 		 779 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_1057  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36 
 
 		 574 aa  313  4.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.67 
 
 		 569 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.26 
 
 		 779 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.12 
 
 		 779 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  35.44 
 
 		 779 aa  312  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.92 
 
 		 564 aa  312  1e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  34.85 
 
 		 571 aa  311  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.44 
 
 		 779 aa  312  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.94 
 
 		 567 aa  311  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.96 
 
 		 785 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1993  ssDNA exonuclease RecJ  37.92 
 
 		 584 aa  311  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.26 
 
 		 779 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.44 
 
 		 779 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  35.26 
 
 		 779 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  37.28 
 
 		 577 aa  311  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.46 
 
 		 571 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.23 
 
 		 576 aa  310  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.52 
 
 		 654 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.81 
 
 		 732 aa  310  5e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  37.46 
 
 		 577 aa  310  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3186  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.76 
 
 		 846 aa  310  5e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28913  normal  1 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  37.46 
 
 		 577 aa  310  5e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.333614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.07 
 
 		 580 aa  310  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  33.28 
 
 		 568 aa  310  5.9999999999999995e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.97 
 
 		 568 aa  310  6.999999999999999e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.35 
 
 		 579 aa  308  1.0000000000000001e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0564  ssDNA exonuclease RecJ  37.72 
 
 		 579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.755584  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  37.32 
 
 		 577 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2372  exonuclease RecJ  33.9 
 
 		 730 aa  307  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.945407  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  37.32 
 
 		 577 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.74 
 
 		 571 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4538  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.95 
 
 		 813 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.954569 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.57 
 
 		 579 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  37.32 
 
 		 577 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  37.32 
 
 		 577 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  37.15 
 
 		 577 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.25 
 
 		 572 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.04 
 
 		 989 aa  306  9.000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  32.99 
 
 		 742 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.87 
 
 		 569 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 		 801 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_39440  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.39 
 
 		 569 aa  304  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.31407  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.64 
 
 		 574 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.36 
 
 		 571 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.33 
 
 		 569 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
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NC_014248  Aazo_3592  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.5 
 
 		 696 aa  303  8.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.800679  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  37.52 
 
 		 579 aa  302  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  36.41 
 
 		 577 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  36.41 
 
 		 577 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  36.41 
 
 		 577 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  36.41 
 
 		 577 aa  301  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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