More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1195 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  63.3 
 
 		 570 aa  772    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 584 aa  1210    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  55.73 
 
 		 574 aa  706    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  53.83 
 
 		 566 aa  644    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.17 
 
 		 568 aa  614  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.52 
 
 		 567 aa  598  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  52.44 
 
 		 568 aa  598  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.09 
 
 		 568 aa  593  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.97 
 
 		 584 aa  558  1e-157  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.95 
 
 		 564 aa  556  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.22 
 
 		 587 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.39 
 
 		 571 aa  450  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.53 
 
 		 568 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.21 
 
 		 570 aa  438  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  41.65 
 
 		 571 aa  434  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.41 
 
 		 885 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.17 
 
 		 574 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.89 
 
 		 573 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
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NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  38.68 
 
 		 568 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.59 
 
 		 907 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.95 
 
 		 573 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  38.05 
 
 		 578 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.17 
 
 		 573 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.56 
 
 		 785 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.09 
 
 		 570 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.08 
 
 		 578 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.28 
 
 		 827 aa  382  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 		 572 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.8 
 
 		 798 aa  379  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.81 
 
 		 779 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 		 779 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.48 
 
 		 779 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.48 
 
 		 779 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.48 
 
 		 779 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.3 
 
 		 779 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.3 
 
 		 773 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.16 
 
 		 779 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.3 
 
 		 779 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.3 
 
 		 779 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.3 
 
 		 811 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.94 
 
 		 788 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.3 
 
 		 779 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.52 
 
 		 572 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.54 
 
 		 586 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.61 
 
 		 574 aa  363  6e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.65 
 
 		 579 aa  361  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.86 
 
 		 831 aa  357  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.68 
 
 		 568 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.41 
 
 		 801 aa  353  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  34.97 
 
 		 592 aa  352  7e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.25 
 
 		 583 aa  351  3e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.48 
 
 		 569 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.22 
 
 		 814 aa  347  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  34.88 
 
 		 932 aa  342  8e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.48 
 
 		 579 aa  342  1e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.56 
 
 		 573 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.03 
 
 		 599 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.15 
 
 		 564 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  33.8 
 
 		 566 aa  337  5e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.21 
 
 		 573 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.67 
 
 		 592 aa  333  6e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.82 
 
 		 654 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.5 
 
 		 592 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.82 
 
 		 566 aa  326  6e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.82 
 
 		 566 aa  326  6e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.45 
 
 		 989 aa  326  7e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.58 
 
 		 1035 aa  326  7e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.69 
 
 		 757 aa  323  7e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.1 
 
 		 573 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.28 
 
 		 573 aa  322  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.95 
 
 		 574 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.18 
 
 		 911 aa  319  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0292  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.56 
 
 		 577 aa  317  5e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.13 
 
 		 757 aa  316  7e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.13 
 
 		 757 aa  316  7e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.56 
 
 		 571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.66 
 
 		 569 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.49 
 
 		 569 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2372  exonuclease RecJ  33.02 
 
 		 730 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.945407  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.97 
 
 		 569 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.07 
 
 		 732 aa  307  3e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.92 
 
 		 865 aa  306  7e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.14 
 
 		 569 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.87 
 
 		 1102 aa  305  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0138959 
 
 
-
 
NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 579 aa  305  2.0000000000000002e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.54 
 
 		 977 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.37 
 
 		 655 aa  303  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.37 
 
 		 655 aa  303  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.69 
 
 		 578 aa  302  9e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_0208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.26 
 
 		 763 aa  302  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  34.07 
 
 		 742 aa  302  1e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.91 
 
 		 571 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.08 
 
 		 571 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013171  Apre_0909  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.68 
 
 		 576 aa  300  4e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  33.03 
 
 		 756 aa  300  4e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
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NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  32.57 
 
 		 736 aa  298  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.16 
 
 		 864 aa  298  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
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NC_008312  Tery_4190  exonuclease RecJ  32 
 
 		 701 aa  297  4e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  31.98 
 
 		 684 aa  296  5e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  33.39 
 
 		 579 aa  296  7e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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