More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2614 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 578 aa  1143    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  66.14 
 
 		 578 aa  742    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  62.3 
 
 		 573 aa  716    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.12 
 
 		 569 aa  599  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.2 
 
 		 568 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.87 
 
 		 586 aa  549  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.56 
 
 		 599 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.55 
 
 		 573 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.37 
 
 		 573 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.29 
 
 		 574 aa  485  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.39 
 
 		 564 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.4 
 
 		 885 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.91 
 
 		 907 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.8 
 
 		 814 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.36 
 
 		 570 aa  434  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  42.93 
 
 		 592 aa  433  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.91 
 
 		 788 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.13 
 
 		 573 aa  425  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.96 
 
 		 779 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.96 
 
 		 779 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.91 
 
 		 785 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.26 
 
 		 571 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.61 
 
 		 779 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.61 
 
 		 779 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.61 
 
 		 773 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.44 
 
 		 779 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.26 
 
 		 573 aa  412  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.89 
 
 		 827 aa  411  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  39.44 
 
 		 779 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  39.61 
 
 		 779 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.44 
 
 		 779 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.61 
 
 		 779 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.91 
 
 		 572 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.6 
 
 		 568 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.22 
 
 		 572 aa  402  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  35.47 
 
 		 574 aa  402  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.2 
 
 		 779 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.57 
 
 		 811 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.76 
 
 		 570 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.56 
 
 		 568 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40 
 
 		 801 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  36.84 
 
 		 566 aa  395  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.78 
 
 		 989 aa  397  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.19 
 
 		 570 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  39.86 
 
 		 932 aa  393  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.67 
 
 		 831 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.08 
 
 		 584 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.79 
 
 		 573 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.41 
 
 		 579 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.59 
 
 		 798 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.96 
 
 		 574 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.76 
 
 		 568 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.98 
 
 		 574 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  37.43 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.62 
 
 		 977 aa  369  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  36.59 
 
 		 568 aa  372  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.11 
 
 		 583 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.28 
 
 		 567 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.42 
 
 		 579 aa  369  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
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NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  37.95 
 
 		 742 aa  366  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.75 
 
 		 587 aa  361  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  41.37 
 
 		 565 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.6 
 
 		 564 aa  360  5e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  41.01 
 
 		 566 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
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NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.5 
 
 		 592 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.26 
 
 		 911 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
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NC_002620  TC0732  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.58 
 
 		 582 aa  355  8.999999999999999e-97  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.213373  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 592 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  37.3 
 
 		 571 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease protein  42.73 
 
 		 565 aa  353  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00151931  normal  0.274168 
 
 
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NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.87 
 
 		 566 aa  352  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  39.69 
 
 		 566 aa  350  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.13 
 
 		 573 aa  350  5e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
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NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.85 
 
 		 864 aa  350  5e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  40.9 
 
 		 571 aa  349  9e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
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NC_013440  Hoch_2398  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.54 
 
 		 577 aa  348  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.96 
 
 		 566 aa  348  2e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.85 
 
 		 883 aa  347  3e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1474  single-strand DNA-specific exonuclease  39.36 
 
 		 573 aa  347  3e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.5 
 
 		 576 aa  347  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.44 
 
 		 732 aa  347  4e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.69 
 
 		 569 aa  347  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  34.79 
 
 		 584 aa  347  4e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.78 
 
 		 589 aa  347  5e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  41.64 
 
 		 577 aa  346  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.84 
 
 		 584 aa  346  8e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.56 
 
 		 579 aa  346  8e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  41.79 
 
 		 577 aa  346  8e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.98 
 
 		 566 aa  346  8e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_3376  exonuclease RecJ  41.16 
 
 		 569 aa  346  8.999999999999999e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.593595 
 
 
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NC_008709  Ping_3302  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.81 
 
 		 572 aa  345  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.117483 
 
 
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NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.25 
 
 		 569 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  41.79 
 
 		 577 aa  344  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.333614 
 
 
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NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  39.25 
 
 		 569 aa  345  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  41.79 
 
 		 577 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  37.04 
 
 		 655 aa  343  5e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.92 
 
 		 580 aa  342  9e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_2314  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.82 
 
 		 560 aa  342  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.843202  n/a   
 
 
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NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.04 
 
 		 578 aa  342  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  40.24 
 
 		 577 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
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