More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4190 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2372  exonuclease RecJ  58.85 
 
 
730 aa  851    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.945407  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.76 
 
 
655 aa  807    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  50.44 
 
 
684 aa  671    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3592  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  60.29 
 
 
696 aa  821    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.800679  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  61.83 
 
 
654 aa  863    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.76 
 
 
655 aa  807    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4190  exonuclease RecJ  100 
 
 
701 aa  1439    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4538  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.11 
 
 
813 aa  702    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.954569 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1157  RecJ exonuclease  39.5 
 
 
632 aa  393  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.884679  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1318  exonuclease RecJ  39.18 
 
 
618 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0453835 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14521  Serine/threonine specific protein phosphatase  35.83 
 
 
632 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10381  DHH domain-containing protein  33.49 
 
 
629 aa  349  9e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112269 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0357  exonuclease RecJ  33.54 
 
 
622 aa  348  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.5723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.73 
 
 
885 aa  347  4e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.97 
 
 
573 aa  345  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09101  single-stranded DNA-specific exonuclease  34.62 
 
 
625 aa  342  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000188211 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.64 
 
 
785 aa  340  7e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.47 
 
 
814 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.32 
 
 
827 aa  325  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.06 
 
 
811 aa  324  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.14 
 
 
788 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.34 
 
 
779 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.22 
 
 
773 aa  317  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.86 
 
 
779 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.86 
 
 
779 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.04 
 
 
779 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.22 
 
 
779 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.86 
 
 
779 aa  312  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.28 
 
 
907 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.86 
 
 
779 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.86 
 
 
779 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  33.86 
 
 
779 aa  310  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.96 
 
 
831 aa  310  8e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.73 
 
 
570 aa  310  8e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  33.69 
 
 
779 aa  309  9e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.78 
 
 
572 aa  309  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.28 
 
 
572 aa  307  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  32.17 
 
 
574 aa  306  6e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.36 
 
 
586 aa  306  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.72 
 
 
583 aa  305  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.91 
 
 
592 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.82 
 
 
801 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.5 
 
 
568 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.82 
 
 
574 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.1 
 
 
757 aa  303  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.1 
 
 
757 aa  303  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.59 
 
 
592 aa  302  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.98 
 
 
989 aa  301  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.8 
 
 
570 aa  301  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.34 
 
 
763 aa  300  7e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.73 
 
 
732 aa  298  2e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  32.26 
 
 
592 aa  298  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  33.99 
 
 
932 aa  297  4e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32 
 
 
584 aa  297  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.15 
 
 
584 aa  297  6e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.72 
 
 
568 aa  294  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.86 
 
 
579 aa  293  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2715  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.64 
 
 
568 aa  292  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.036762  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.95 
 
 
571 aa  292  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.45 
 
 
574 aa  291  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.35 
 
 
573 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.51 
 
 
757 aa  289  1e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1953  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.65 
 
 
576 aa  289  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  32.5 
 
 
566 aa  289  1e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.03 
 
 
864 aa  288  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0292  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.17 
 
 
577 aa  287  5e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.44 
 
 
798 aa  286  7e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  32.83 
 
 
579 aa  286  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.6 
 
 
578 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.03 
 
 
883 aa  284  4.0000000000000003e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.94 
 
 
579 aa  284  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.89 
 
 
566 aa  283  6.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.85 
 
 
568 aa  283  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550153 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0876  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.73 
 
 
592 aa  283  9e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0250964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1993  ssDNA exonuclease RecJ  31.8 
 
 
584 aa  283  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.31 
 
 
977 aa  281  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.22 
 
 
573 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.39 
 
 
580 aa  280  6e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0780382 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  33.51 
 
 
577 aa  280  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.27 
 
 
570 aa  279  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.73 
 
 
566 aa  277  5e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.26 
 
 
578 aa  276  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  31.14 
 
 
578 aa  276  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  31.05 
 
 
736 aa  273  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.91 
 
 
576 aa  272  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.99 
 
 
599 aa  271  4e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  32.31 
 
 
577 aa  270  5.9999999999999995e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.333614 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  32.31 
 
 
577 aa  270  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1602  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.45 
 
 
823 aa  270  7e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  32.13 
 
 
577 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4094  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.45 
 
 
584 aa  269  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  31.65 
 
 
577 aa  268  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.25 
 
 
572 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  31.65 
 
 
577 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  31.65 
 
 
577 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  31.65 
 
 
577 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_2272  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.5 
 
 
577 aa  268  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  31.65 
 
 
577 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  31.65 
 
 
577 aa  267  4e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.84 
 
 
571 aa  267  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
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