More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2871 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  71.76 
 
 		 655 aa  989    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  71.76 
 
 		 655 aa  989    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2372  exonuclease RecJ  60.45 
 
 		 730 aa  829    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.945407  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  54.05 
 
 		 684 aa  672    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4538  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  63.7 
 
 		 813 aa  710    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.954569 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4190  exonuclease RecJ  61.83 
 
 		 701 aa  863    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3592  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  62.79 
 
 		 696 aa  831    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.800679  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 654 aa  1334    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1157  RecJ exonuclease  40.98 
 
 		 632 aa  425  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.884679  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14521  Serine/threonine specific protein phosphatase  38 
 
 		 632 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1318  exonuclease RecJ  40.98 
 
 		 618 aa  415  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0453835 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10381  DHH domain-containing protein  36.57 
 
 		 629 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112269 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0357  exonuclease RecJ  36.14 
 
 		 622 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.5723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.16 
 
 		 885 aa  363  6e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.14 
 
 		 827 aa  359  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.08 
 
 		 814 aa  356  6.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09101  single-stranded DNA-specific exonuclease  35.64 
 
 		 625 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188211 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.77 
 
 		 785 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.3 
 
 		 586 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.55 
 
 		 788 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.28 
 
 		 907 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.58 
 
 		 811 aa  334  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.35 
 
 		 568 aa  333  5e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.82 
 
 		 584 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.27 
 
 		 568 aa  327  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.23 
 
 		 574 aa  326  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.38 
 
 		 763 aa  325  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.07 
 
 		 831 aa  324  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.71 
 
 		 573 aa  324  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.15 
 
 		 583 aa  323  9.000000000000001e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.91 
 
 		 570 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.25 
 
 		 572 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.67 
 
 		 573 aa  320  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.72 
 
 		 757 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.72 
 
 		 757 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  33.68 
 
 		 574 aa  318  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  36.52 
 
 		 932 aa  317  4e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.43 
 
 		 779 aa  316  8e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.43 
 
 		 779 aa  316  8e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  35.71 
 
 		 566 aa  316  8e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.31 
 
 		 570 aa  316  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.73 
 
 		 572 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.19 
 
 		 779 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.24 
 
 		 773 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.32 
 
 		 857 aa  314  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.74 
 
 		 801 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.43 
 
 		 779 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.98 
 
 		 779 aa  312  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.43 
 
 		 779 aa  312  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.08 
 
 		 566 aa  311  2e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.43 
 
 		 779 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.05 
 
 		 779 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.24 
 
 		 779 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  34.84 
 
 		 566 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.79 
 
 		 779 aa  310  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.52 
 
 		 574 aa  310  5e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.12 
 
 		 584 aa  310  8e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.01 
 
 		 989 aa  309  9e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.44 
 
 		 566 aa  307  3e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.91 
 
 		 572 aa  308  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  33.39 
 
 		 592 aa  307  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.39 
 
 		 578 aa  306  7e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1953  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.45 
 
 		 576 aa  306  8.000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.89 
 
 		 599 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.79 
 
 		 757 aa  303  9e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.78 
 
 		 592 aa  302  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2715  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.54 
 
 		 568 aa  302  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.036762  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.86 
 
 		 574 aa  300  6e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.48 
 
 		 580 aa  300  7e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0780382 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.61 
 
 		 592 aa  299  8e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.86 
 
 		 574 aa  299  9e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.9 
 
 		 798 aa  299  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.7 
 
 		 864 aa  299  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.83 
 
 		 587 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.92 
 
 		 568 aa  296  8e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.32 
 
 		 883 aa  296  1e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3302  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.9 
 
 		 572 aa  295  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.117483 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.28 
 
 		 570 aa  294  4e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.15 
 
 		 571 aa  294  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  33.68 
 
 		 578 aa  294  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  36.24 
 
 		 569 aa  293  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.58 
 
 		 732 aa  291  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.69 
 
 		 579 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.88 
 
 		 569 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1993  ssDNA exonuclease RecJ  33.75 
 
 		 584 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.16 
 
 		 571 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.75 
 
 		 568 aa  290  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  33.69 
 
 		 579 aa  290  7e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  34.48 
 
 		 742 aa  290  7e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  31.68 
 
 		 655 aa  290  7e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  32.93 
 
 		 568 aa  289  9e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.1 
 
 		 579 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.29 
 
 		 567 aa  289  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.88 
 
 		 569 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
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NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  30.52 
 
 		 756 aa  288  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_3376  exonuclease RecJ  36.11 
 
 		 569 aa  287  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.593595 
 
 
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NC_008309  HS_1474  single-strand DNA-specific exonuclease  35.02 
 
 		 573 aa  287  4e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.5 
 
 		 569 aa  287  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  34.4 
 
 		 577 aa  286  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_4094  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.16 
 
 		 584 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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