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for query gene Ccel_1953 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1953  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 576 aa  1179    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.73 
 
 		 592 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.22 
 
 		 592 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_0876  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.32 
 
 		 592 aa  537  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0250964  n/a   
 
 
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NC_013171  Apre_0909  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.28 
 
 		 576 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.1 
 
 		 827 aa  365  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.4 
 
 		 785 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.73 
 
 		 885 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.4 
 
 		 788 aa  352  8e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.67 
 
 		 989 aa  348  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.55 
 
 		 757 aa  346  7e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.55 
 
 		 757 aa  346  7e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.7 
 
 		 779 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.52 
 
 		 779 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.52 
 
 		 779 aa  343  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.88 
 
 		 907 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.03 
 
 		 811 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 		 779 aa  342  8e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 		 779 aa  342  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.35 
 
 		 779 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.35 
 
 		 779 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.17 
 
 		 779 aa  340  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.17 
 
 		 779 aa  340  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.62 
 
 		 570 aa  339  8e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.28 
 
 		 773 aa  339  8e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.58 
 
 		 779 aa  339  9e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.73 
 
 		 801 aa  332  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  34.03 
 
 		 684 aa  332  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.64 
 
 		 573 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.26 
 
 		 732 aa  331  3e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.55 
 
 		 572 aa  325  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.69 
 
 		 798 aa  325  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.7 
 
 		 814 aa  324  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.19 
 
 		 568 aa  322  8e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.4 
 
 		 572 aa  320  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  35.41 
 
 		 932 aa  319  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.93 
 
 		 655 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.93 
 
 		 655 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  34.33 
 
 		 742 aa  316  9e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  35.64 
 
 		 756 aa  315  9.999999999999999e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
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NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.48 
 
 		 977 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.2 
 
 		 579 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.58 
 
 		 574 aa  312  9e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.12 
 
 		 955 aa  312  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  33.39 
 
 		 571 aa  312  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.74 
 
 		 955 aa  312  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.97 
 
 		 864 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.46 
 
 		 570 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.19 
 
 		 578 aa  310  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  32.7 
 
 		 655 aa  310  5e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.5 
 
 		 566 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.42 
 
 		 568 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.22 
 
 		 831 aa  308  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  31.79 
 
 		 566 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  33.09 
 
 		 566 aa  307  3e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.12 
 
 		 570 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.45 
 
 		 654 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.79 
 
 		 583 aa  305  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.08 
 
 		 587 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  34.21 
 
 		 736 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  31.09 
 
 		 574 aa  303  7.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.15 
 
 		 883 aa  302  1e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 757 aa  301  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.09 
 
 		 584 aa  300  3e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2372  exonuclease RecJ  32.54 
 
 		 730 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.945407  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.47 
 
 		 1035 aa  300  5e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.35 
 
 		 573 aa  299  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.06 
 
 		 566 aa  299  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.26 
 
 		 599 aa  297  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.38 
 
 		 865 aa  296  6e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.51 
 
 		 564 aa  294  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.02 
 
 		 567 aa  293  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  31.19 
 
 		 578 aa  292  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.58 
 
 		 574 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.39 
 
 		 586 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.49 
 
 		 571 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4538  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.17 
 
 		 813 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.954569 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4190  exonuclease RecJ  32.65 
 
 		 701 aa  289  8e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  31.49 
 
 		 577 aa  289  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.49 
 
 		 568 aa  289  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.38 
 
 		 584 aa  286  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32 
 
 		 573 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.84 
 
 		 571 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0519  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.09 
 
 		 1120 aa  282  1e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.388344  hitchhiker  0.00158278 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3592  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 696 aa  281  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.800679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.97 
 
 		 857 aa  281  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0863  ssDNA exonuclease RecJ  31.22 
 
 		 584 aa  281  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.49 
 
 		 576 aa  281  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.46 
 
 		 568 aa  280  6e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  31.59 
 
 		 577 aa  280  8e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  31.59 
 
 		 577 aa  279  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  31.59 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.59 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  31.59 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  31.48 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  31.59 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  31.59 
 
 		 577 aa  277  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  31.41 
 
 		 577 aa  277  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  31.48 
 
 		 577 aa  277  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  31.48 
 
 		 577 aa  277  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.333614 
 
 
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