More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0900 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



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Fosmid unclonability p-value
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PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 857 aa  1703    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.25 
 
 		 885 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.33 
 
 		 865 aa  459  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.37 
 
 		 907 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.4 
 
 		 814 aa  365  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.65 
 
 		 811 aa  365  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.02 
 
 		 785 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.12 
 
 		 732 aa  355  2e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.64 
 
 		 788 aa  355  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.86 
 
 		 827 aa  349  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.25 
 
 		 831 aa  345  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.45 
 
 		 989 aa  344  4e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.71 
 
 		 1102 aa  342  2e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0138959 
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.4 
 
 		 573 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.33 
 
 		 573 aa  340  8e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.21 
 
 		 779 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.21 
 
 		 779 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.25 
 
 		 568 aa  338  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.01 
 
 		 779 aa  336  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 		 564 aa  335  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.76 
 
 		 779 aa  335  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.36 
 
 		 773 aa  335  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.01 
 
 		 779 aa  334  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.58 
 
 		 779 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.01 
 
 		 779 aa  333  9e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.78 
 
 		 779 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.14 
 
 		 779 aa  333  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.03 
 
 		 779 aa  332  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.95 
 
 		 586 aa  332  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.34 
 
 		 801 aa  331  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_2721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.11 
 
 		 1122 aa  330  6e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.95 
 
 		 578 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  33.8 
 
 		 566 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.3 
 
 		 570 aa  327  5e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  39.37 
 
 		 578 aa  326  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.9 
 
 		 583 aa  325  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.4 
 
 		 572 aa  325  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  38.72 
 
 		 932 aa  325  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.41 
 
 		 757 aa  324  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.41 
 
 		 757 aa  324  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.03 
 
 		 572 aa  323  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  36.76 
 
 		 736 aa  323  9.999999999999999e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.96 
 
 		 579 aa  320  5e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.32 
 
 		 654 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.98 
 
 		 655 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.98 
 
 		 655 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013170  Ccur_04000  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.5 
 
 		 1134 aa  319  2e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.544211 
 
 
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NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.07 
 
 		 567 aa  318  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.79 
 
 		 566 aa  319  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.65 
 
 		 568 aa  318  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.54 
 
 		 574 aa  317  5e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.21 
 
 		 568 aa  317  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  34.99 
 
 		 655 aa  314  4.999999999999999e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.85 
 
 		 571 aa  313  6.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.28 
 
 		 977 aa  313  1e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.88 
 
 		 566 aa  311  2e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.96 
 
 		 1035 aa  311  2.9999999999999997e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.77 
 
 		 568 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  35.91 
 
 		 742 aa  310  1.0000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.73 
 
 		 566 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.03 
 
 		 570 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.65 
 
 		 570 aa  308  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  33.39 
 
 		 568 aa  306  7e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.93 
 
 		 757 aa  306  9.000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.54 
 
 		 955 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.16 
 
 		 584 aa  306  1.0000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.3 
 
 		 573 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.21 
 
 		 798 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.78 
 
 		 955 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.29 
 
 		 574 aa  304  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.14 
 
 		 592 aa  303  9e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.6 
 
 		 592 aa  303  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
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NC_013203  Apar_0519  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.27 
 
 		 1120 aa  302  2e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.388344  hitchhiker  0.00158278 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.45 
 
 		 864 aa  300  7e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.79 
 
 		 584 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.58 
 
 		 587 aa  297  5e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.25 
 
 		 883 aa  296  9e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  31.98 
 
 		 574 aa  296  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1953  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.97 
 
 		 576 aa  295  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36 
 
 		 578 aa  295  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  36.88 
 
 		 592 aa  295  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  36.18 
 
 		 571 aa  290  9e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  36.38 
 
 		 684 aa  290  9e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.39 
 
 		 580 aa  289  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0780382 
 
 
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NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  33.53 
 
 		 756 aa  288  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.4 
 
 		 911 aa  286  9e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
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NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  35.7 
 
 		 568 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_2398  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.65 
 
 		 577 aa  284  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  0.955687 
 
 
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NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.34 
 
 		 573 aa  282  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.49 
 
 		 571 aa  281  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_2314  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.83 
 
 		 560 aa  281  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.843202  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.81 
 
 		 569 aa  280  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.82 
 
 		 574 aa  277  7e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_008312  Tery_4190  exonuclease RecJ  32.64 
 
 		 701 aa  277  7e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009976  P9211_09101  single-stranded DNA-specific exonuclease  35.15 
 
 		 625 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188211 
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.03 
 
 		 564 aa  275  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4538  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.29 
 
 		 813 aa  273  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.954569 
 
 
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NC_007413  Ava_2372  exonuclease RecJ  34.29 
 
 		 730 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.945407  normal  0.30551 
 
 
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NC_014248  Aazo_3592  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.43 
 
 		 696 aa  271  4e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.800679  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.21 
 
 		 573 aa  271  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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