More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0208 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 763 aa  1563    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.88 
 
 		 798 aa  334  3e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  37.55 
 
 		 932 aa  328  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.38 
 
 		 654 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.68 
 
 		 885 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.26 
 
 		 573 aa  324  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.12 
 
 		 655 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.12 
 
 		 655 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.31 
 
 		 785 aa  320  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  30.46 
 
 		 779 aa  319  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.33 
 
 		 779 aa  318  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.7 
 
 		 773 aa  318  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.15 
 
 		 827 aa  318  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.82 
 
 		 779 aa  318  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.7 
 
 		 570 aa  317  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.4 
 
 		 955 aa  317  7e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.05 
 
 		 779 aa  316  8e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.53 
 
 		 955 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.51 
 
 		 573 aa  315  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_009976  P9211_09101  single-stranded DNA-specific exonuclease  31.4 
 
 		 625 aa  314  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188211 
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.29 
 
 		 779 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.29 
 
 		 779 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.43 
 
 		 779 aa  313  9e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.31 
 
 		 977 aa  313  9e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.48 
 
 		 586 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.66 
 
 		 811 aa  310  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.93 
 
 		 779 aa  310  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  29.93 
 
 		 779 aa  310  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.93 
 
 		 779 aa  310  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.15 
 
 		 599 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.16 
 
 		 814 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.58 
 
 		 578 aa  309  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.75 
 
 		 568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.93 
 
 		 864 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.26 
 
 		 732 aa  308  3e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.59 
 
 		 989 aa  308  4.0000000000000004e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.48 
 
 		 571 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.55 
 
 		 801 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  34.06 
 
 		 566 aa  306  9.000000000000001e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.61 
 
 		 907 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.88 
 
 		 574 aa  303  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4538  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.91 
 
 		 813 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.954569 
 
 
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NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.26 
 
 		 584 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008312  Tery_4190  exonuclease RecJ  31.34 
 
 		 701 aa  300  7e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.56 
 
 		 573 aa  300  7e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.14 
 
 		 564 aa  300  9e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_2372  exonuclease RecJ  30.14 
 
 		 730 aa  299  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.945407  normal  0.30551 
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.32 
 
 		 568 aa  299  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_008309  HS_1474  single-strand DNA-specific exonuclease  33.45 
 
 		 573 aa  298  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.33 
 
 		 831 aa  298  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.35 
 
 		 573 aa  297  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  32.35 
 
 		 684 aa  298  4e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014248  Aazo_3592  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.86 
 
 		 696 aa  296  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.800679  n/a   
 
 
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NC_011726  PCC8801_2493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.53 
 
 		 776 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.28 
 
 		 757 aa  296  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.28 
 
 		 757 aa  296  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008312  Tery_0618  exonuclease RecJ  31.28 
 
 		 810 aa  295  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195781  decreased coverage  0.00316903 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.67 
 
 		 757 aa  295  3e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2719  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.39 
 
 		 767 aa  295  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34 
 
 		 579 aa  295  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.41 
 
 		 776 aa  294  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.340424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.03 
 
 		 883 aa  293  7e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.22 
 
 		 574 aa  291  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3773  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.48 
 
 		 785 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1157  RecJ exonuclease  31.5 
 
 		 632 aa  290  7e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.884679  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.64 
 
 		 567 aa  290  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  31.82 
 
 		 574 aa  289  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.43 
 
 		 592 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.43 
 
 		 592 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.86 
 
 		 788 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1318  exonuclease RecJ  31.89 
 
 		 618 aa  287  4e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0453835 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 570 aa  287  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  32.48 
 
 		 592 aa  287  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.79 
 
 		 574 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.89 
 
 		 568 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  33.21 
 
 		 571 aa  284  5.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14521  Serine/threonine specific protein phosphatase  31.24 
 
 		 632 aa  283  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0825  exonuclease RecJ  28.31 
 
 		 772 aa  283  8.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.356276 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0772  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.83 
 
 		 574 aa  283  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167693  hitchhiker  0.00446395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.16 
 
 		 573 aa  282  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.76 
 
 		 566 aa  283  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  36.27 
 
 		 736 aa  283  1e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.05 
 
 		 570 aa  282  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  33.15 
 
 		 578 aa  281  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.34 
 
 		 587 aa  281  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.12 
 
 		 569 aa  281  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  33.4 
 
 		 568 aa  280  5e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  32.16 
 
 		 742 aa  280  6e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.35 
 
 		 580 aa  280  7e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0780382 
 
 
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NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  33.76 
 
 		 655 aa  280  9e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.37 
 
 		 566 aa  280  1e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_0845  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.97 
 
 		 577 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_3522  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.97 
 
 		 577 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  31.77 
 
 		 756 aa  278  4e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_3641  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.97 
 
 		 577 aa  277  6e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011663  Sbal223_3447  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.97 
 
 		 574 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_0897  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.93 
 
 		 574 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.55 
 
 		 572 aa  276  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_013512  Sdel_0046  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.53 
 
 		 527 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.55 
 
 		 584 aa  274  4.0000000000000004e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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