139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1505 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  69.41 
 
 		 466 aa  684    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  100 
 
 		 461 aa  944    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  59.39 
 
 		 469 aa  557  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  50.43 
 
 		 469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  48.61 
 
 		 473 aa  429  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  47.31 
 
 		 477 aa  425  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  47.33 
 
 		 492 aa  423  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  47.39 
 
 		 515 aa  421  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  46.64 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  37.44 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  36.85 
 
 		 466 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  35.84 
 
 		 465 aa  257  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  33.26 
 
 		 468 aa  252  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  35.38 
 
 		 465 aa  246  8e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  35.23 
 
 		 427 aa  236  9e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  34.78 
 
 		 467 aa  226  6e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  34.78 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  34.02 
 
 		 467 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  33.41 
 
 		 431 aa  220  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  32.9 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  32.76 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  32.26 
 
 		 437 aa  209  8e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  30.45 
 
 		 473 aa  207  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  32.69 
 
 		 452 aa  206  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  32.03 
 
 		 420 aa  203  5e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  33.71 
 
 		 467 aa  200  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  31.08 
 
 		 459 aa  190  4e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  31.61 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  33.43 
 
 		 465 aa  182  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  30.92 
 
 		 468 aa  178  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  27.48 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  28.97 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  25.11 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  26.8 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  31.44 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  28.04 
 
 		 566 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2314  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.21 
 
 		 560 aa  58.9  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.843202  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.04 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.57 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.66 
 
 		 776 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.340424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.66 
 
 		 776 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.11 
 
 		 955 aa  55.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.51 
 
 		 955 aa  54.7  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0618  exonuclease RecJ  29.39 
 
 		 810 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195781  decreased coverage  0.00316903 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2554  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.93 
 
 		 723 aa  54.3  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.54 
 
 		 857 aa  53.1  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0860  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.71 
 
 		 644 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  30.56 
 
 		 581 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2719  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.62 
 
 		 767 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.67 
 
 		 574 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.48 
 
 		 811 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4190  exonuclease RecJ  27.32 
 
 		 701 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1032  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.86 
 
 		 564 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0519  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.74 
 
 		 1120 aa  52.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.388344  hitchhiker  0.00158278 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0455  single-stranded DNA exonuclease  28.78 
 
 		 602 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3186  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.07 
 
 		 846 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  28.57 
 
 		 569 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1602  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.97 
 
 		 823 aa  51.6  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0396  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.26 
 
 		 602 aa  51.2  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.44 
 
 		 1102 aa  50.1  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0138959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.82 
 
 		 654 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.87 
 
 		 989 aa  49.7  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.22 
 
 		 572 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.23 
 
 		 1035 aa  49.3  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0292  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.4 
 
 		 577 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.78 
 
 		 569 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  26.26 
 
 		 684 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.22 
 
 		 569 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.78 
 
 		 569 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4538  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.17 
 
 		 813 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.954569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.15 
 
 		 801 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09101  single-stranded DNA-specific exonuclease  26.67 
 
 		 625 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.83 
 
 		 583 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.53 
 
 		 563 aa  47.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0732  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.41 
 
 		 582 aa  47.4  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.213373  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.61 
 
 		 865 aa  47.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.22 
 
 		 569 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.47 
 
 		 831 aa  47.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  26.09 
 
 		 932 aa  47  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.24 
 
 		 574 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.25 
 
 		 574 aa  47  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.37 
 
 		 578 aa  47  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  26.52 
 
 		 592 aa  46.6  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0212  hypothetical protein  27.48 
 
 		 335 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.71 
 
 		 655 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.43 
 
 		 571 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.81 
 
 		 779 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.81 
 
 		 572 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.33 
 
 		 571 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04000  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  22.47 
 
 		 1134 aa  46.6  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.544211 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.01 
 
 		 779 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.71 
 
 		 655 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1698  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.07 
 
 		 564 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.07 
 
 		 564 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2588  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.07 
 
 		 564 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2642  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.07 
 
 		 564 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1478  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.07 
 
 		 564 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.75 
 
 		 885 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  30.23 
 
 		 577 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.43 
 
 		 570 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>