55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2008 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 		 515 aa  1030    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  75.38 
 
 		 500 aa  729    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  65.28 
 
 		 492 aa  634  1e-180  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  65.43 
 
 		 473 aa  612  9.999999999999999e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  61.72 
 
 		 469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  47.39 
 
 		 461 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.24 
 
 		 466 aa  431  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  46.63 
 
 		 469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  39.54 
 
 		 477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  37.47 
 
 		 468 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  34.92 
 
 		 468 aa  252  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  34.83 
 
 		 465 aa  240  5e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  35.83 
 
 		 465 aa  239  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  32.23 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  33.53 
 
 		 427 aa  224  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  30.8 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  31.12 
 
 		 467 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  30.72 
 
 		 467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  30.85 
 
 		 468 aa  203  5e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  31.19 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  29.76 
 
 		 473 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  30.04 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  30.23 
 
 		 452 aa  176  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  32.36 
 
 		 465 aa  170  6e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  28.08 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  27.88 
 
 		 431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  28.08 
 
 		 431 aa  163  7e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  26.72 
 
 		 432 aa  146  9e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  26.37 
 
 		 420 aa  141  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  24.03 
 
 		 459 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  35.34 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  28.31 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  32.51 
 
 		 405 aa  88.6  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  24.59 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  35.59 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.09 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  23.61 
 
 		 566 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.76 
 
 		 566 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.67 
 
 		 573 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1214  phosphoesterase RecJ domain protein  28.64 
 
 		 545 aa  53.5  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0990291  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1032  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.11 
 
 		 564 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.62 
 
 		 563 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.07 
 
 		 1035 aa  50.4  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.6 
 
 		 989 aa  48.5  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.6 
 
 		 571 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.4 
 
 		 574 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.73 
 
 		 610 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3760  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.7 
 
 		 610 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.671236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  25.12 
 
 		 932 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1460  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.14 
 
 		 574 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.48 
 
 		 955 aa  43.9  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.29 
 
 		 776 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.340424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.83 
 
 		 572 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.29 
 
 		 776 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.09 
 
 		 955 aa  43.9  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>