More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1563 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  66.44 
 
 		 603 aa  747    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.93 
 
 		 613 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  57.83 
 
 		 613 aa  643    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.59 
 
 		 613 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.33 
 
 		 613 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 610 aa  1211    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
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NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.1 
 
 		 613 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
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NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  56.67 
 
 		 613 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.26 
 
 		 633 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
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NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.57 
 
 		 626 aa  617  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.01 
 
 		 611 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.94 
 
 		 611 aa  608  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.4 
 
 		 605 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  56.62 
 
 		 600 aa  605  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.83 
 
 		 600 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.33 
 
 		 600 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.75 
 
 		 597 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
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NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.94 
 
 		 611 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.907848 
 
 
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NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.95 
 
 		 603 aa  594  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  55.05 
 
 		 594 aa  592  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.43 
 
 		 597 aa  589  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.1 
 
 		 594 aa  568  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.77 
 
 		 594 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.27 
 
 		 575 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.24 
 
 		 594 aa  536  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.92 
 
 		 600 aa  537  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
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NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  47.69 
 
 		 606 aa  498  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.24 
 
 		 579 aa  483  1e-135  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.33 
 
 		 594 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.91 
 
 		 582 aa  473  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
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NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.67 
 
 		 603 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  49.58 
 
 		 585 aa  466  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  41.96 
 
 		 584 aa  464  1e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.27 
 
 		 589 aa  464  1e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.06 
 
 		 580 aa  465  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.17 
 
 		 583 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.17 
 
 		 583 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  49.17 
 
 		 583 aa  458  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.09 
 
 		 573 aa  443  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.89 
 
 		 605 aa  435  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.39 
 
 		 603 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.42 
 
 		 588 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  44.8 
 
 		 592 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.63 
 
 		 619 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
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NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.4 
 
 		 588 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.858016 
 
 
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NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.24 
 
 		 577 aa  392  1e-107  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.41 
 
 		 574 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.82 
 
 		 573 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.36 
 
 		 586 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.92 
 
 		 578 aa  324  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.04 
 
 		 599 aa  323  8e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.42 
 
 		 573 aa  311  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.7 
 
 		 814 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  37.1 
 
 		 932 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.2 
 
 		 564 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.09 
 
 		 568 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.83 
 
 		 573 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.48 
 
 		 573 aa  297  4e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.23 
 
 		 569 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.68 
 
 		 798 aa  294  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.21 
 
 		 574 aa  293  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.24 
 
 		 573 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  36.35 
 
 		 578 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.74 
 
 		 907 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.24 
 
 		 579 aa  289  1e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.67 
 
 		 811 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.68 
 
 		 885 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.22 
 
 		 827 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0628  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.42 
 
 		 599 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.44 
 
 		 576 aa  283  6.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.63 
 
 		 831 aa  282  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.57 
 
 		 785 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.94 
 
 		 1035 aa  275  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.87 
 
 		 570 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  36.83 
 
 		 566 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.77 
 
 		 573 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.65 
 
 		 570 aa  274  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.98 
 
 		 788 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.16 
 
 		 801 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  35.76 
 
 		 581 aa  274  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.17 
 
 		 574 aa  273  9e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.87 
 
 		 587 aa  273  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1417  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.68 
 
 		 579 aa  272  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.17 
 
 		 574 aa  272  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
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NC_008751  Dvul_2080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.07 
 
 		 580 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0780382 
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  33.58 
 
 		 684 aa  270  5.9999999999999995e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.52 
 
 		 578 aa  270  8e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1567  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.68 
 
 		 579 aa  269  8.999999999999999e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.21 
 
 		 584 aa  268  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.08 
 
 		 583 aa  268  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.86 
 
 		 568 aa  267  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.11 
 
 		 568 aa  266  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  32.68 
 
 		 655 aa  265  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_1189  RecJ exonuclease  36.06 
 
 		 574 aa  265  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35 
 
 		 580 aa  264  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.26 
 
 		 779 aa  264  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.03 
 
 		 568 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_013440  Hoch_2398  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.55 
 
 		 577 aa  263  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  0.955687 
 
 
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NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  35.09 
 
 		 571 aa  263  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
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NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.34 
 
 		 571 aa  262  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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