More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3014 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  69.27 
 
 
588 aa  751    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  66.67 
 
 
573 aa  707    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 
588 aa  1138    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.858016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.95 
 
 
603 aa  550  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
-
 
NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.59 
 
 
579 aa  469  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.4 
 
 
610 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.553946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.55 
 
 
633 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.29 
 
 
626 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.55 
 
 
613 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.06 
 
 
613 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.29 
 
 
594 aa  458  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  46.86 
 
 
606 aa  458  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.39 
 
 
613 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.71 
 
 
589 aa  458  1e-127  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.97 
 
 
603 aa  456  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.29 
 
 
603 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.58 
 
 
605 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  40.66 
 
 
584 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  46.31 
 
 
613 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.05 
 
 
613 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.28 
 
 
603 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  48.64 
 
 
585 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.75 
 
 
583 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  46.81 
 
 
613 aa  445  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  49.41 
 
 
583 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.02 
 
 
594 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.32 
 
 
611 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.69 
 
 
594 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  45.03 
 
 
594 aa  438  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.24 
 
 
583 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.07 
 
 
600 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.42 
 
 
575 aa  430  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.56 
 
 
605 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  46.46 
 
 
600 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.03 
 
 
582 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.97 
 
 
611 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.98 
 
 
611 aa  425  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.907848 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.6 
 
 
594 aa  422  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.02 
 
 
600 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.53 
 
 
580 aa  415  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.65 
 
 
577 aa  412  1e-113  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.49 
 
 
597 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.74 
 
 
597 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.58 
 
 
600 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
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NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.38 
 
 
619 aa  405  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  42.01 
 
 
592 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.82 
 
 
568 aa  324  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.41 
 
 
574 aa  318  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.14 
 
 
814 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.81 
 
 
573 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.18 
 
 
578 aa  299  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.25 
 
 
563 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.72 
 
 
827 aa  298  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.99 
 
 
586 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.3 
 
 
732 aa  295  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1070  single-stranded DNA-specific exonuclease  34.81 
 
 
622 aa  292  1e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.34 
 
 
576 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.16 
 
 
773 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.34 
 
 
811 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.51 
 
 
779 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  40.3 
 
 
565 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.51 
 
 
779 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.24 
 
 
779 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.74 
 
 
779 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1771  exonuclease RecJ  41.81 
 
 
565 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.722264 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.24 
 
 
779 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.07 
 
 
779 aa  287  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1470  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.43 
 
 
586 aa  286  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.9 
 
 
779 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.57 
 
 
779 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  40.58 
 
 
566 aa  286  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  33.9 
 
 
779 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.15 
 
 
574 aa  285  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.9 
 
 
779 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  40.04 
 
 
566 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.25 
 
 
885 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  38.35 
 
 
579 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1474  single-strand DNA-specific exonuclease  36.78 
 
 
573 aa  284  3.0000000000000004e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.96 
 
 
574 aa  284  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  39.39 
 
 
577 aa  283  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  34.51 
 
 
742 aa  283  7.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2026  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.04 
 
 
565 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2153  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.04 
 
 
565 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000147893  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1567  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.59 
 
 
579 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.52 
 
 
574 aa  281  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.79 
 
 
579 aa  280  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1993  ssDNA exonuclease RecJ  36.64 
 
 
584 aa  280  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.38 
 
 
574 aa  280  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1417  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.4 
 
 
579 aa  280  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.94 
 
 
785 aa  279  8e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_3376  exonuclease RecJ  39.77 
 
 
569 aa  279  9e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.593595 
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.42 
 
 
599 aa  279  9e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.168372 
 
 
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NC_009092  Shew_0772  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.52 
 
 
574 aa  279  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167693  hitchhiker  0.00446395 
 
 
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NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.38 
 
 
572 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.21 
 
 
907 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_012560  Avin_39440  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.96 
 
 
569 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.31407  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  37.79 
 
 
581 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.86 
 
 
569 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.810057 
 
 
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NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.84 
 
 
580 aa  277  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3302  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.45 
 
 
572 aa  276  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.117483 
 
 
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