More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2502 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 
619 aa  1192    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.52 
 
 
594 aa  640    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.74 
 
 
603 aa  502  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  48.31 
 
 
606 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.99 
 
 
626 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.63 
 
 
610 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.553946 
 
 
-
 
NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.13 
 
 
594 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.89 
 
 
589 aa  424  1e-117  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  39.04 
 
 
584 aa  419  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.32 
 
 
611 aa  420  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.97 
 
 
575 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.79 
 
 
594 aa  422  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.66 
 
 
605 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.89 
 
 
611 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  45.13 
 
 
594 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.1 
 
 
600 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.24 
 
 
600 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.97 
 
 
603 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.33 
 
 
611 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.907848 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  44.75 
 
 
613 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  45.27 
 
 
600 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.8 
 
 
594 aa  405  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.3 
 
 
613 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.18 
 
 
613 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.03 
 
 
613 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.28 
 
 
573 aa  398  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.54 
 
 
579 aa  395  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.02 
 
 
633 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
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NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.11 
 
 
603 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.61 
 
 
588 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.35 
 
 
613 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.65 
 
 
582 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.65 
 
 
600 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
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NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.86 
 
 
580 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  44.46 
 
 
585 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.87 
 
 
583 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.46 
 
 
603 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  42.69 
 
 
613 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  44.2 
 
 
583 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.03 
 
 
583 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.53 
 
 
597 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.79 
 
 
597 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.94 
 
 
605 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.72 
 
 
577 aa  372  1e-101  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.38 
 
 
588 aa  362  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.858016 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  39.23 
 
 
592 aa  350  5e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.5 
 
 
907 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.46 
 
 
574 aa  303  9e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.58 
 
 
586 aa  302  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.97 
 
 
578 aa  299  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.24 
 
 
573 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.16 
 
 
599 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.168372 
 
 
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NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.54 
 
 
757 aa  281  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.54 
 
 
757 aa  281  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.84 
 
 
885 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.67 
 
 
573 aa  280  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 
568 aa  277  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.91 
 
 
564 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.33 
 
 
573 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.42 
 
 
578 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  37.01 
 
 
578 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3310  ssDNA exonuclease RecJ  37.19 
 
 
577 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.24828  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.91 
 
 
573 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.06 
 
 
572 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.47 
 
 
798 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  36.49 
 
 
577 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  36.49 
 
 
577 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  36.49 
 
 
577 aa  270  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  36.88 
 
 
577 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  36.49 
 
 
577 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  36.08 
 
 
932 aa  269  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  36.49 
 
 
577 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.61 
 
 
732 aa  268  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.95 
 
 
569 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  36.4 
 
 
577 aa  267  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  36.4 
 
 
577 aa  267  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  31.16 
 
 
742 aa  267  4e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  36.4 
 
 
577 aa  267  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.4 
 
 
577 aa  267  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  36.4 
 
 
577 aa  267  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  36.4 
 
 
577 aa  267  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  36.4 
 
 
577 aa  266  8e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.6 
 
 
568 aa  264  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2737  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.81 
 
 
574 aa  264  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  36.22 
 
 
577 aa  264  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  32.64 
 
 
655 aa  264  4e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.03 
 
 
571 aa  263  8e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.35 
 
 
572 aa  262  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.92 
 
 
811 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.11 
 
 
576 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.69 
 
 
827 aa  259  8e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.51 
 
 
757 aa  259  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.78 
 
 
801 aa  259  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.58 
 
 
573 aa  259  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.73 
 
 
1035 aa  259  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.75 
 
 
587 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_006369  lpl1567  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.08 
 
 
579 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 
785 aa  258  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.42 
 
 
788 aa  257  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.88 
 
 
570 aa  256  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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