More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2797 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  73.15 
 
 		 611 aa  765    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  72.92 
 
 		 611 aa  758    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  69.09 
 
 		 597 aa  684    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  69.8 
 
 		 597 aa  701    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 605 aa  1174    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  72.99 
 
 		 611 aa  752    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.907848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.4 
 
 		 610 aa  631  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
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NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  58.23 
 
 		 613 aa  622  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.76 
 
 		 613 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.17 
 
 		 626 aa  617  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  57.64 
 
 		 613 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.55 
 
 		 613 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.06 
 
 		 613 aa  609  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.43 
 
 		 613 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.93 
 
 		 633 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.72 
 
 		 603 aa  591  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.72 
 
 		 600 aa  568  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.56 
 
 		 594 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.7 
 
 		 600 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.6 
 
 		 603 aa  552  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
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NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.56 
 
 		 594 aa  552  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  53.48 
 
 		 594 aa  548  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  53.3 
 
 		 600 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.97 
 
 		 575 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.28 
 
 		 594 aa  525  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.36 
 
 		 600 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.83 
 
 		 580 aa  482  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  49.5 
 
 		 585 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.81 
 
 		 579 aa  466  9.999999999999999e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  48.22 
 
 		 606 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.64 
 
 		 594 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.46 
 
 		 603 aa  468  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  41.55 
 
 		 584 aa  452  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.21 
 
 		 603 aa  450  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
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NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.48 
 
 		 582 aa  448  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.75 
 
 		 583 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  49.32 
 
 		 583 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.75 
 
 		 573 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
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NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.69 
 
 		 589 aa  444  1e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.32 
 
 		 583 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
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NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.76 
 
 		 605 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.65 
 
 		 588 aa  438  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.66 
 
 		 619 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
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NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.2 
 
 		 577 aa  416  9.999999999999999e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  44.05 
 
 		 592 aa  418  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.56 
 
 		 588 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.858016 
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.18 
 
 		 568 aa  336  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.4 
 
 		 573 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.65 
 
 		 586 aa  320  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.36 
 
 		 599 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.2 
 
 		 578 aa  318  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.69 
 
 		 814 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.97 
 
 		 574 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.28 
 
 		 907 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.74 
 
 		 573 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.79 
 
 		 573 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.11 
 
 		 564 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.74 
 
 		 827 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  38.81 
 
 		 578 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.13 
 
 		 811 aa  300  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.2 
 
 		 788 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.08 
 
 		 885 aa  298  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.35 
 
 		 576 aa  297  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  34.99 
 
 		 932 aa  296  7e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  38.3 
 
 		 571 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
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CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  37.41 
 
 		 577 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.24 
 
 		 577 aa  294  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  37.32 
 
 		 577 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  37.32 
 
 		 577 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  37.32 
 
 		 577 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  37.41 
 
 		 577 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  37.24 
 
 		 577 aa  293  5e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  37.32 
 
 		 577 aa  293  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  37.41 
 
 		 577 aa  293  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  37.32 
 
 		 577 aa  293  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  37.24 
 
 		 577 aa  293  8e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.52 
 
 		 572 aa  292  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  36.86 
 
 		 577 aa  292  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.91 
 
 		 580 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1564  RecJ exonuclease  38.61 
 
 		 568 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373395  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.82 
 
 		 573 aa  291  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  37.24 
 
 		 577 aa  291  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  37.24 
 
 		 577 aa  291  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.87 
 
 		 571 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.83 
 
 		 569 aa  289  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1698  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.78 
 
 		 564 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.78 
 
 		 564 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2205  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.78 
 
 		 564 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3113  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.78 
 
 		 564 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2642  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.78 
 
 		 564 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1478  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.78 
 
 		 564 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2588  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.78 
 
 		 564 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  35.9 
 
 		 566 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.69 
 
 		 571 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008340  Mlg_1819  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40 
 
 		 577 aa  286  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_1817  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.66 
 
 		 585 aa  287  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0771206 
 
 
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NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.23 
 
 		 573 aa  286  8e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_1154  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.83 
 
 		 565 aa  286  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
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NC_010551  BamMC406_2026  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.65 
 
 		 565 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698536 
 
 
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NC_008390  Bamb_2153  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.65 
 
 		 565 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000147893  n/a   
 
 
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