More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0405 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  100 
 
 
583 aa  1133    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  99.83 
 
 
583 aa  1132    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  68.45 
 
 
582 aa  751    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  68.69 
 
 
585 aa  764    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  71.38 
 
 
603 aa  799    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  94 
 
 
583 aa  1051    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  64.24 
 
 
580 aa  682    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.01 
 
 
603 aa  529  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.17 
 
 
610 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.553946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.74 
 
 
626 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49 
 
 
603 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.75 
 
 
594 aa  472  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.9 
 
 
600 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.78 
 
 
589 aa  459  9.999999999999999e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.07 
 
 
600 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.6 
 
 
594 aa  460  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  48.98 
 
 
606 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  48.13 
 
 
594 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.18 
 
 
603 aa  453  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.72 
 
 
594 aa  449  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  40.41 
 
 
584 aa  449  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.34 
 
 
611 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.99 
 
 
573 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.71 
 
 
613 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.92 
 
 
611 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.56 
 
 
613 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.89 
 
 
633 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.7 
 
 
594 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  45.53 
 
 
600 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.34 
 
 
597 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.26 
 
 
597 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  47.56 
 
 
613 aa  442  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.32 
 
 
605 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.89 
 
 
613 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.66 
 
 
613 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.09 
 
 
611 aa  438  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.907848 
 
 
-
 
NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.64 
 
 
579 aa  433  1e-120  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.5 
 
 
575 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  45.48 
 
 
613 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.35 
 
 
600 aa  418  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.41 
 
 
588 aa  412  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.858016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.37 
 
 
588 aa  402  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.2 
 
 
619 aa  385  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
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NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.87 
 
 
605 aa  382  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.18 
 
 
577 aa  381  1e-104  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  41.08 
 
 
592 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.12 
 
 
599 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.5 
 
 
586 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.26 
 
 
574 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.8 
 
 
573 aa  307  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.53 
 
 
811 aa  297  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.11 
 
 
568 aa  293  9e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.09 
 
 
814 aa  291  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  34.79 
 
 
932 aa  291  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.46 
 
 
732 aa  289  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.59 
 
 
570 aa  287  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.87 
 
 
573 aa  283  6.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  35.48 
 
 
578 aa  280  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.52 
 
 
578 aa  280  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.12 
 
 
568 aa  280  6e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.48 
 
 
574 aa  279  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.51 
 
 
573 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.68 
 
 
573 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.85 
 
 
564 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  38.68 
 
 
566 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.53 
 
 
757 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.53 
 
 
757 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.99 
 
 
788 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.22 
 
 
785 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.69 
 
 
587 aa  272  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  30.14 
 
 
574 aa  272  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.58 
 
 
798 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.3 
 
 
827 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.97 
 
 
569 aa  270  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.98 
 
 
907 aa  269  8e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.58 
 
 
885 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  37.79 
 
 
565 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  38.04 
 
 
577 aa  267  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  35.12 
 
 
574 aa  267  5e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.12 
 
 
574 aa  266  8e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  39 
 
 
577 aa  266  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  38.95 
 
 
577 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  38.95 
 
 
577 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.333614 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.5 
 
 
568 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.5 
 
 
977 aa  265  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.69 
 
 
576 aa  265  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2758  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.94 
 
 
574 aa  264  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  36.35 
 
 
577 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  36.35 
 
 
577 aa  263  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  36.35 
 
 
577 aa  263  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  36.35 
 
 
577 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0952  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.9 
 
 
574 aa  262  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  30.14 
 
 
568 aa  262  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.76 
 
 
569 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  32.15 
 
 
742 aa  262  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  36.17 
 
 
577 aa  261  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  36.17 
 
 
577 aa  261  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_1057  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.35 
 
 
574 aa  261  3e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.58 
 
 
569 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.31 
 
 
584 aa  260  5.0000000000000005e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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