More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1270 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 
594 aa  1184    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.43 
 
 
594 aa  676    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  60.68 
 
 
600 aa  652    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  62.03 
 
 
600 aa  670    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  61.42 
 
 
600 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  69.1 
 
 
594 aa  784    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  93.77 
 
 
594 aa  1095    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  99.83 
 
 
575 aa  1139    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  61.42 
 
 
600 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.48 
 
 
626 aa  608  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  54.31 
 
 
613 aa  590  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.64 
 
 
613 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.31 
 
 
613 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.3 
 
 
633 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.77 
 
 
610 aa  587  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.553946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.45 
 
 
613 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.05 
 
 
613 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.03 
 
 
603 aa  566  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  53.1 
 
 
613 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.56 
 
 
605 aa  551  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.68 
 
 
603 aa  547  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.31 
 
 
611 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.52 
 
 
597 aa  538  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.3 
 
 
611 aa  531  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.98 
 
 
611 aa  528  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.907848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.92 
 
 
597 aa  521  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  46.89 
 
 
606 aa  478  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.54 
 
 
594 aa  477  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.13 
 
 
603 aa  474  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.36 
 
 
582 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.07 
 
 
583 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.72 
 
 
583 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  48.72 
 
 
583 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.61 
 
 
603 aa  446  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  45.95 
 
 
585 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.69 
 
 
580 aa  439  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.71 
 
 
573 aa  442  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.03 
 
 
588 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  40.31 
 
 
584 aa  427  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.1 
 
 
579 aa  424  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.13 
 
 
619 aa  423  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.65 
 
 
589 aa  423  1e-117  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.29 
 
 
605 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.02 
 
 
588 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.858016 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.49 
 
 
577 aa  373  1e-102  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  38.82 
 
 
592 aa  358  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.61 
 
 
568 aa  320  5e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.93 
 
 
599 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.54 
 
 
574 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.69 
 
 
586 aa  300  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.66 
 
 
814 aa  297  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.15 
 
 
811 aa  296  9e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.54 
 
 
785 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.36 
 
 
788 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.8 
 
 
573 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.46 
 
 
578 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  36.49 
 
 
578 aa  291  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.17 
 
 
573 aa  290  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.02 
 
 
773 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.63 
 
 
779 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.63 
 
 
779 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.64 
 
 
564 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.54 
 
 
779 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.86 
 
 
885 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  36.28 
 
 
566 aa  286  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 
907 aa  286  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.34 
 
 
827 aa  286  9e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40 
 
 
573 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.99 
 
 
779 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.63 
 
 
779 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.45 
 
 
779 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.45 
 
 
779 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.45 
 
 
779 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  36.67 
 
 
932 aa  283  8.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  33.45 
 
 
779 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  33.45 
 
 
779 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.04 
 
 
574 aa  279  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.3 
 
 
579 aa  277  4e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.74 
 
 
569 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.57 
 
 
569 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.8 
 
 
569 aa  274  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.83 
 
 
584 aa  273  6e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1817  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.32 
 
 
585 aa  273  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0771206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  35.84 
 
 
571 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.4 
 
 
569 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.58 
 
 
574 aa  271  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1417  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.81 
 
 
579 aa  270  4e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.58 
 
 
574 aa  270  4e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.42 
 
 
568 aa  270  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.36 
 
 
798 aa  270  7e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.74 
 
 
569 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1567  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.63 
 
 
579 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  34.6 
 
 
569 aa  269  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.83 
 
 
563 aa  269  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.96 
 
 
587 aa  269  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35 
 
 
574 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_1771  exonuclease RecJ  37.57 
 
 
565 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.722264 
 
 
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NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  35.28 
 
 
581 aa  268  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.54 
 
 
580 aa  267  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.28 
 
 
564 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497812  normal  0.288787 
 
 
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