More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2059 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  99.83 
 
 		 583 aa  1132    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  68.51 
 
 		 585 aa  763    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 583 aa  1134    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  68.45 
 
 		 582 aa  752    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  93.83 
 
 		 583 aa  1049    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
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NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  71.21 
 
 		 603 aa  797    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
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NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  64.06 
 
 		 580 aa  681    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.84 
 
 		 603 aa  527  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.17 
 
 		 610 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
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NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49 
 
 		 603 aa  477  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.57 
 
 		 626 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.58 
 
 		 594 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.9 
 
 		 600 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.51 
 
 		 589 aa  459  9.999999999999999e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.07 
 
 		 600 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.6 
 
 		 594 aa  459  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  48.13 
 
 		 594 aa  455  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  48.81 
 
 		 606 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.34 
 
 		 611 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.72 
 
 		 594 aa  450  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  40.14 
 
 		 584 aa  449  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.71 
 
 		 613 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.01 
 
 		 603 aa  451  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.81 
 
 		 573 aa  448  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.92 
 
 		 611 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  47.56 
 
 		 613 aa  443  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
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NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  45.53 
 
 		 600 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.56 
 
 		 613 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.89 
 
 		 633 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
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NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.7 
 
 		 594 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.34 
 
 		 597 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.09 
 
 		 611 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.907848 
 
 
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NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.89 
 
 		 613 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
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NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.26 
 
 		 597 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
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NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.66 
 
 		 613 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.75 
 
 		 605 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
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NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.64 
 
 		 579 aa  434  1e-120  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.5 
 
 		 575 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  45.48 
 
 		 613 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.35 
 
 		 600 aa  418  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
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NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.24 
 
 		 588 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.858016 
 
 
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NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.19 
 
 		 588 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.03 
 
 		 619 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
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NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.18 
 
 		 577 aa  382  1e-104  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.71 
 
 		 605 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  40.91 
 
 		 592 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.12 
 
 		 599 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.5 
 
 		 586 aa  319  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.26 
 
 		 574 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.8 
 
 		 573 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.53 
 
 		 811 aa  297  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.11 
 
 		 568 aa  293  9e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.09 
 
 		 814 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.46 
 
 		 732 aa  289  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  34.62 
 
 		 932 aa  288  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.93 
 
 		 570 aa  287  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.87 
 
 		 573 aa  283  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  35.76 
 
 		 578 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.52 
 
 		 578 aa  281  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.12 
 
 		 568 aa  280  7e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.51 
 
 		 573 aa  279  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.48 
 
 		 574 aa  279  8e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.68 
 
 		 573 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.85 
 
 		 564 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  38.68 
 
 		 566 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
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NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.53 
 
 		 757 aa  274  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.53 
 
 		 757 aa  274  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.69 
 
 		 587 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.22 
 
 		 785 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  30.14 
 
 		 574 aa  272  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.58 
 
 		 798 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.79 
 
 		 569 aa  271  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.98 
 
 		 907 aa  270  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.81 
 
 		 788 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.58 
 
 		 885 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.12 
 
 		 827 aa  269  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  37.79 
 
 		 565 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  38.04 
 
 		 577 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  35.12 
 
 		 574 aa  267  5e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.12 
 
 		 574 aa  266  7e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  39.19 
 
 		 577 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  39.15 
 
 		 577 aa  266  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.333614 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  39.15 
 
 		 577 aa  266  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.5 
 
 		 568 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.69 
 
 		 576 aa  265  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2758  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.94 
 
 		 574 aa  264  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  36.35 
 
 		 577 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  36.35 
 
 		 577 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_0952  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.1 
 
 		 574 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  36.35 
 
 		 577 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.31 
 
 		 977 aa  262  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  36.35 
 
 		 577 aa  262  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  36.17 
 
 		 577 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  30.14 
 
 		 568 aa  262  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.76 
 
 		 569 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  36.17 
 
 		 577 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  32.15 
 
 		 742 aa  261  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.23 
 
 		 569 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_1057  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.35 
 
 		 574 aa  261  3e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.58 
 
 		 569 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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