More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3002 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  67.3 
 
 		 583 aa  721    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  68.45 
 
 		 583 aa  728    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  68.45 
 
 		 583 aa  729    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 582 aa  1145    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  68.38 
 
 		 603 aa  775    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  65.46 
 
 		 585 aa  717    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.27 
 
 		 580 aa  616  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.75 
 
 		 603 aa  511  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
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NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.17 
 
 		 603 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.91 
 
 		 610 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.86 
 
 		 600 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.61 
 
 		 613 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  47.69 
 
 		 594 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.2 
 
 		 626 aa  462  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  46.13 
 
 		 613 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.35 
 
 		 600 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.28 
 
 		 613 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
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NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.13 
 
 		 613 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.62 
 
 		 633 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.52 
 
 		 594 aa  457  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
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NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.17 
 
 		 589 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.72 
 
 		 613 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  46.76 
 
 		 600 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  45.91 
 
 		 613 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  40.49 
 
 		 584 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.22 
 
 		 594 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.84 
 
 		 573 aa  448  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
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NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.36 
 
 		 594 aa  443  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  47.79 
 
 		 606 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.94 
 
 		 603 aa  436  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.26 
 
 		 575 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.29 
 
 		 579 aa  423  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.48 
 
 		 605 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.45 
 
 		 611 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.45 
 
 		 611 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.96 
 
 		 597 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.92 
 
 		 594 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.39 
 
 		 600 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
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NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.45 
 
 		 611 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.907848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.14 
 
 		 597 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.86 
 
 		 588 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.65 
 
 		 619 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
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NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.27 
 
 		 577 aa  377  1e-103  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.03 
 
 		 588 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.858016 
 
 
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NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.2 
 
 		 605 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  41.12 
 
 		 592 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.52 
 
 		 599 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.15 
 
 		 573 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  36.95 
 
 		 932 aa  306  8.000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.43 
 
 		 586 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.99 
 
 		 568 aa  302  9e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.18 
 
 		 578 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.08 
 
 		 827 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.34 
 
 		 811 aa  296  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_39440  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.6 
 
 		 569 aa  294  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.31407  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.57 
 
 		 814 aa  294  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.89 
 
 		 573 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_3376  exonuclease RecJ  40.39 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.593595 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.02 
 
 		 564 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.89 
 
 		 573 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.7 
 
 		 574 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.93 
 
 		 907 aa  287  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.01 
 
 		 571 aa  286  9e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.69 
 
 		 571 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.98 
 
 		 569 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  39.4 
 
 		 571 aa  283  9e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.32 
 
 		 569 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  39.4 
 
 		 565 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.15 
 
 		 569 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  38.83 
 
 		 566 aa  282  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  38.46 
 
 		 577 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  38.46 
 
 		 577 aa  280  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.333614 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  38.46 
 
 		 577 aa  280  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.62 
 
 		 569 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.62 
 
 		 569 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  34.9 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  36.92 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2737  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.87 
 
 		 574 aa  278  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.84 
 
 		 572 aa  278  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  36.99 
 
 		 577 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  36.99 
 
 		 577 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  36.99 
 
 		 577 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.89 
 
 		 574 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  37.5 
 
 		 577 aa  276  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  36.99 
 
 		 577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  37.79 
 
 		 569 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  36.99 
 
 		 577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  36.7 
 
 		 577 aa  274  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  36.7 
 
 		 577 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  36.7 
 
 		 577 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.32 
 
 		 788 aa  273  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  35.25 
 
 		 574 aa  273  6e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.25 
 
 		 574 aa  273  7e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease protein  39.82 
 
 		 565 aa  272  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00151931  normal  0.274168 
 
 
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NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  36.52 
 
 		 577 aa  272  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  36.52 
 
 		 577 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  36.52 
 
 		 577 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  36.97 
 
 		 566 aa  272  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.8 
 
 		 773 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.78 
 
 		 798 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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