More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2274 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 573 aa  1118    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  66.67 
 
 		 588 aa  659    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.858016 
 
 
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NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  68.07 
 
 		 588 aa  729    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.18 
 
 		 603 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
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NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.53 
 
 		 626 aa  463  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.32 
 
 		 579 aa  459  9.999999999999999e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.84 
 
 		 582 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
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NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.29 
 
 		 603 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
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NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.75 
 
 		 603 aa  457  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.09 
 
 		 610 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
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NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  50.18 
 
 		 606 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.8 
 
 		 613 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.34 
 
 		 589 aa  452  1e-125  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  46.42 
 
 		 594 aa  452  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  42.09 
 
 		 584 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.51 
 
 		 613 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.23 
 
 		 603 aa  445  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  50.99 
 
 		 583 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  47.51 
 
 		 613 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.06 
 
 		 600 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.81 
 
 		 583 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.09 
 
 		 613 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
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NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.09 
 
 		 633 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
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NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  45.91 
 
 		 613 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.09 
 
 		 583 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
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NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.32 
 
 		 613 aa  435  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.03 
 
 		 611 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.64 
 
 		 580 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.59 
 
 		 605 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
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NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  47.67 
 
 		 585 aa  428  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.85 
 
 		 611 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.25 
 
 		 594 aa  423  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
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NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.5 
 
 		 594 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.5 
 
 		 575 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.97 
 
 		 594 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.15 
 
 		 600 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
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NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  45.88 
 
 		 600 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.71 
 
 		 594 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.91 
 
 		 597 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
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NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.9 
 
 		 597 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.67 
 
 		 611 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.907848 
 
 
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NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.42 
 
 		 605 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal  1 
 
 
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NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.32 
 
 		 577 aa  403  1e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.08 
 
 		 619 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
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NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.52 
 
 		 600 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  42.08 
 
 		 592 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.41 
 
 		 573 aa  325  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.39 
 
 		 574 aa  320  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.75 
 
 		 779 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.75 
 
 		 779 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.92 
 
 		 773 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  37.57 
 
 		 779 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.57 
 
 		 779 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.39 
 
 		 779 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  37.57 
 
 		 779 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.39 
 
 		 779 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.84 
 
 		 586 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.11 
 
 		 568 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.13 
 
 		 814 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.03 
 
 		 779 aa  307  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.03 
 
 		 779 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.67 
 
 		 779 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 732 aa  300  4e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.46 
 
 		 578 aa  296  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.49 
 
 		 563 aa  293  5e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.52 
 
 		 907 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_008709  Ping_3302  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.92 
 
 		 572 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.117483 
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  39.04 
 
 		 578 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.99 
 
 		 811 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  37.95 
 
 		 581 aa  286  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.09 
 
 		 574 aa  286  9e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.71 
 
 		 599 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.52 
 
 		 885 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_0958  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.5 
 
 		 564 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.388256  normal  0.0147257 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  39.7 
 
 		 579 aa  283  6.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.29 
 
 		 564 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497812  normal  0.288787 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease protein  40.57 
 
 		 565 aa  282  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00151931  normal  0.274168 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  38.77 
 
 		 566 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0772  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.81 
 
 		 574 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167693  hitchhiker  0.00446395 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.21 
 
 		 574 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.28 
 
 		 572 aa  280  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0952  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.5 
 
 		 574 aa  279  9e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2737  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.23 
 
 		 574 aa  279  9e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.98 
 
 		 785 aa  279  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.72 
 
 		 827 aa  279  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1993  ssDNA exonuclease RecJ  37.92 
 
 		 584 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.85 
 
 		 579 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009379  Pnuc_1470  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.64 
 
 		 586 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  38.83 
 
 		 565 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  38.93 
 
 		 577 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  38.93 
 
 		 577 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
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NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  38.93 
 
 		 577 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.25 
 
 		 574 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  35.31 
 
 		 932 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  40.17 
 
 		 566 aa  273  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
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NC_008309  HS_1474  single-strand DNA-specific exonuclease  37.67 
 
 		 573 aa  273  6e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.01 
 
 		 571 aa  273  7e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  33.53 
 
 		 756 aa  273  7e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.59 
 
 		 576 aa  273  8.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  38.93 
 
 		 577 aa  273  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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