More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3073 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  66.44 
 
 		 610 aa  761    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
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NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.48 
 
 		 613 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 603 aa  1182    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.48 
 
 		 613 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.72 
 
 		 626 aa  631  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.4 
 
 		 613 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
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NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  55.87 
 
 		 613 aa  624  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
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NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57 
 
 		 633 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
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NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  57.24 
 
 		 613 aa  624  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.52 
 
 		 613 aa  616  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.1 
 
 		 611 aa  586  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.61 
 
 		 611 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  54.65 
 
 		 594 aa  579  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.78 
 
 		 611 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.907848 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.15 
 
 		 600 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.63 
 
 		 605 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  53.67 
 
 		 600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.49 
 
 		 600 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
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NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.85 
 
 		 603 aa  567  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
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NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.03 
 
 		 594 aa  559  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.52 
 
 		 594 aa  559  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.9 
 
 		 597 aa  554  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
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NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.11 
 
 		 597 aa  548  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.34 
 
 		 575 aa  541  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50 
 
 		 594 aa  535  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.36 
 
 		 600 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
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NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.17 
 
 		 582 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
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NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.07 
 
 		 594 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  49.66 
 
 		 585 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.91 
 
 		 580 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.9 
 
 		 603 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.5 
 
 		 583 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49 
 
 		 583 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  46.87 
 
 		 606 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  49 
 
 		 583 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.65 
 
 		 589 aa  459  9.999999999999999e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.95 
 
 		 603 aa  460  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  43.37 
 
 		 584 aa  449  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.69 
 
 		 605 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal  1 
 
 
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NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.71 
 
 		 579 aa  446  1.0000000000000001e-124  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.23 
 
 		 573 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.3 
 
 		 588 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.29 
 
 		 588 aa  415  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.858016 
 
 
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NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.97 
 
 		 619 aa  412  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  43.72 
 
 		 592 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.88 
 
 		 577 aa  377  1e-103  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.68 
 
 		 573 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.16 
 
 		 586 aa  320  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.21 
 
 		 599 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.71 
 
 		 578 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.93 
 
 		 574 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37 
 
 		 568 aa  316  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.77 
 
 		 564 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.41 
 
 		 573 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.41 
 
 		 573 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.91 
 
 		 574 aa  295  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.12 
 
 		 573 aa  289  8e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.04 
 
 		 827 aa  289  9e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.3 
 
 		 885 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.09 
 
 		 569 aa  287  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  36.61 
 
 		 578 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.99 
 
 		 814 aa  284  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.33 
 
 		 907 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.08 
 
 		 573 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.03 
 
 		 831 aa  281  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.6 
 
 		 811 aa  281  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.3 
 
 		 573 aa  276  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  35.06 
 
 		 932 aa  276  7e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.41 
 
 		 571 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.52 
 
 		 568 aa  272  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.19 
 
 		 788 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.77 
 
 		 579 aa  270  4e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.86 
 
 		 785 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.64 
 
 		 779 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.83 
 
 		 571 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.64 
 
 		 779 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.14 
 
 		 1035 aa  267  4e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  35.17 
 
 		 566 aa  266  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.93 
 
 		 779 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.36 
 
 		 572 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.51 
 
 		 779 aa  266  8e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.64 
 
 		 779 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1417  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.75 
 
 		 579 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.61 
 
 		 779 aa  266  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  32.64 
 
 		 779 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  36.54 
 
 		 571 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1567  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 579 aa  264  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.52 
 
 		 583 aa  264  4e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  32.47 
 
 		 779 aa  264  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.51 
 
 		 779 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.48 
 
 		 571 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_2398  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.15 
 
 		 577 aa  263  8e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  0.955687 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.25 
 
 		 569 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 773 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 779 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  36.47 
 
 		 581 aa  261  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_3702  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.35 
 
 		 571 aa  259  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713364 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.31 
 
 		 576 aa  259  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.59 
 
 		 801 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.82 
 
 		 578 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
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