More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1547 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  73.96 
 
 		 600 aa  859    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  61.89 
 
 		 575 aa  659    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 600 aa  1202    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  61.42 
 
 		 594 aa  679    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  61.08 
 
 		 594 aa  683    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  94.5 
 
 		 600 aa  1115    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  72.45 
 
 		 600 aa  819    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  61.8 
 
 		 594 aa  700    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.82 
 
 		 594 aa  609  1e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.33 
 
 		 610 aa  607  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.82 
 
 		 626 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.09 
 
 		 603 aa  577  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.15 
 
 		 603 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  53.31 
 
 		 613 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.31 
 
 		 613 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.11 
 
 		 613 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.31 
 
 		 613 aa  556  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.26 
 
 		 613 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.69 
 
 		 633 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
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NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  53.39 
 
 		 613 aa  548  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.7 
 
 		 605 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.22 
 
 		 611 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.47 
 
 		 611 aa  528  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.49 
 
 		 611 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.907848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.17 
 
 		 597 aa  525  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.31 
 
 		 597 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.86 
 
 		 582 aa  473  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.89 
 
 		 603 aa  466  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.54 
 
 		 594 aa  465  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.32 
 
 		 603 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  46.55 
 
 		 585 aa  460  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  45.53 
 
 		 606 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.4 
 
 		 583 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  46.9 
 
 		 583 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.9 
 
 		 583 aa  445  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.99 
 
 		 580 aa  435  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.06 
 
 		 573 aa  431  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.85 
 
 		 588 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.33 
 
 		 579 aa  427  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.42 
 
 		 605 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.22 
 
 		 589 aa  409  1e-113  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  38.54 
 
 		 584 aa  403  1e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.1 
 
 		 619 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.41 
 
 		 588 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.858016 
 
 
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NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.5 
 
 		 577 aa  365  2e-99  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  37.52 
 
 		 592 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.83 
 
 		 599 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.73 
 
 		 574 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.48 
 
 		 811 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.4 
 
 		 568 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.99 
 
 		 788 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 814 aa  300  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.5 
 
 		 586 aa  297  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.03 
 
 		 907 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.13 
 
 		 785 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.73 
 
 		 573 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  35.95 
 
 		 577 aa  290  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  35.3 
 
 		 932 aa  290  7e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  35.95 
 
 		 577 aa  290  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  35.95 
 
 		 577 aa  289  9e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.33 
 
 		 573 aa  289  9e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  35.85 
 
 		 577 aa  289  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  35.95 
 
 		 577 aa  289  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.89 
 
 		 564 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  35.95 
 
 		 577 aa  288  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.78 
 
 		 577 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.39 
 
 		 827 aa  288  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  35.78 
 
 		 577 aa  286  5e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  35.78 
 
 		 577 aa  286  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.89 
 
 		 573 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.89 
 
 		 573 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.66 
 
 		 579 aa  284  3.0000000000000004e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.72 
 
 		 885 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.2 
 
 		 798 aa  282  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  34.86 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  34.86 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  34.86 
 
 		 577 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  34.86 
 
 		 577 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  34.86 
 
 		 577 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  31.51 
 
 		 566 aa  278  2e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1448  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.92 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3310  ssDNA exonuclease RecJ  35.87 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.24828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.91 
 
 		 779 aa  278  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.31 
 
 		 578 aa  276  7e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 831 aa  276  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.84 
 
 		 576 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  35.1 
 
 		 577 aa  276  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  35.79 
 
 		 581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.18 
 
 		 569 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_006368  lpp1417  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.27 
 
 		 579 aa  274  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_1070  single-stranded DNA-specific exonuclease  30.43 
 
 		 622 aa  273  9e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006369  lpl1567  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.44 
 
 		 579 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.73 
 
 		 580 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.17 
 
 		 563 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1564  RecJ exonuclease  38.07 
 
 		 568 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373395  normal  0.277595 
 
 
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NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.14 
 
 		 592 aa  270  7e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.22 
 
 		 779 aa  270  8e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.22 
 
 		 779 aa  270  8e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  35.44 
 
 		 577 aa  269  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.333614 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  35.44 
 
 		 577 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
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