More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4733 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 588 aa  1137    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  68.69 
 
 		 573 aa  738    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  69.44 
 
 		 588 aa  708    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.858016 
 
 
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NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.58 
 
 		 603 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
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NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.97 
 
 		 603 aa  468  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.72 
 
 		 613 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.06 
 
 		 613 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.72 
 
 		 633 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
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NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  49.19 
 
 		 613 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
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NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.05 
 
 		 613 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
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NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.04 
 
 		 589 aa  456  1e-127  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.78 
 
 		 626 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.42 
 
 		 610 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
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NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  41.25 
 
 		 584 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.74 
 
 		 611 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.83 
 
 		 579 aa  449  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.91 
 
 		 611 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.907848 
 
 
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NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.74 
 
 		 611 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.46 
 
 		 613 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.85 
 
 		 600 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  47.87 
 
 		 606 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  47.96 
 
 		 613 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  44.31 
 
 		 594 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.65 
 
 		 605 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
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NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.03 
 
 		 594 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.04 
 
 		 594 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.69 
 
 		 594 aa  429  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.97 
 
 		 575 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.9 
 
 		 594 aa  422  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.3 
 
 		 603 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.88 
 
 		 600 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
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NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.86 
 
 		 582 aa  420  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
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NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.66 
 
 		 597 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
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NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.76 
 
 		 603 aa  415  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
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NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.67 
 
 		 605 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  44.37 
 
 		 600 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.83 
 
 		 583 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
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NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.61 
 
 		 619 aa  401  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
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NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  48.37 
 
 		 583 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.65 
 
 		 597 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.39 
 
 		 580 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.19 
 
 		 583 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.15 
 
 		 577 aa  389  1e-107  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  45.59 
 
 		 585 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.3 
 
 		 600 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  42.56 
 
 		 592 aa  362  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.33 
 
 		 574 aa  323  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.38 
 
 		 573 aa  319  9e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.04 
 
 		 773 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.81 
 
 		 779 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.81 
 
 		 779 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.74 
 
 		 779 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.74 
 
 		 779 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.74 
 
 		 779 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.57 
 
 		 779 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.57 
 
 		 779 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.03 
 
 		 779 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.64 
 
 		 785 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.12 
 
 		 568 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.96 
 
 		 779 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.96 
 
 		 779 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.55 
 
 		 586 aa  302  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.55 
 
 		 578 aa  302  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.58 
 
 		 811 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.36 
 
 		 788 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.65 
 
 		 814 aa  290  7e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.4 
 
 		 574 aa  289  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.99 
 
 		 732 aa  288  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_4094  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.55 
 
 		 584 aa  286  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease protein  41.25 
 
 		 565 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00151931  normal  0.274168 
 
 
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NC_004347  SO_0952  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.91 
 
 		 574 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  38.51 
 
 		 579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.93 
 
 		 885 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_1057  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.04 
 
 		 574 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_0772  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.82 
 
 		 574 aa  283  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167693  hitchhiker  0.00446395 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.28 
 
 		 599 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  40.04 
 
 		 565 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.3 
 
 		 579 aa  282  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1470  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.5 
 
 		 586 aa  281  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.8 
 
 		 569 aa  280  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0487  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.53 
 
 		 601 aa  280  7e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.624528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  38.95 
 
 		 578 aa  280  7e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0892  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.88 
 
 		 584 aa  279  9e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.488933  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  38.1 
 
 		 566 aa  279  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3302  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.17 
 
 		 572 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.117483 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1993  ssDNA exonuclease RecJ  37.09 
 
 		 584 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  39.11 
 
 		 566 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.41 
 
 		 572 aa  277  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.71 
 
 		 574 aa  277  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.55 
 
 		 573 aa  277  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.07 
 
 		 907 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  37.6 
 
 		 581 aa  276  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_3641  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.37 
 
 		 577 aa  277  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_3522  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.37 
 
 		 577 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3226  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.71 
 
 		 574 aa  276  8e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.68 
 
 		 564 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497812  normal  0.288787 
 
 
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NC_009052  Sbal_0845  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.37 
 
 		 577 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_1070  single-stranded DNA-specific exonuclease  30.82 
 
 		 622 aa  275  1.0000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_3447  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.2 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_3329  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.71 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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