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for query gene Plav_2948 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 603 aa  1187    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
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NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  55.5 
 
 		 606 aa  597  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.95 
 
 		 610 aa  594  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
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NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.77 
 
 		 626 aa  585  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.26 
 
 		 600 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.76 
 
 		 600 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.48 
 
 		 603 aa  569  1e-161  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  52.95 
 
 		 600 aa  569  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.85 
 
 		 603 aa  556  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  52.28 
 
 		 613 aa  556  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
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NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.08 
 
 		 613 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.02 
 
 		 613 aa  555  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.34 
 
 		 613 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.76 
 
 		 613 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  50.67 
 
 		 594 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.34 
 
 		 633 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
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NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  51.58 
 
 		 613 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.18 
 
 		 573 aa  540  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.08 
 
 		 594 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.84 
 
 		 594 aa  535  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.96 
 
 		 589 aa  535  1e-150  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  45.78 
 
 		 584 aa  530  1e-149  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  51.36 
 
 		 585 aa  525  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.68 
 
 		 594 aa  525  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.6 
 
 		 605 aa  528  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
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NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.72 
 
 		 579 aa  523  1e-147  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.84 
 
 		 600 aa  524  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
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NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.28 
 
 		 611 aa  521  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.58 
 
 		 588 aa  521  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.57 
 
 		 611 aa  519  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.93 
 
 		 605 aa  515  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.28 
 
 		 611 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.907848 
 
 
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NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.92 
 
 		 603 aa  514  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.17 
 
 		 583 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.26 
 
 		 594 aa  510  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.75 
 
 		 582 aa  511  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
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NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  51.01 
 
 		 583 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.88 
 
 		 575 aa  504  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.84 
 
 		 583 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.95 
 
 		 588 aa  500  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.858016 
 
 
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NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.82 
 
 		 580 aa  492  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.74 
 
 		 619 aa  491  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
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NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.36 
 
 		 597 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
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NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.76 
 
 		 597 aa  485  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.15 
 
 		 577 aa  459  9.999999999999999e-129  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  43.24 
 
 		 592 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.62 
 
 		 568 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.76 
 
 		 574 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.89 
 
 		 573 aa  340  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.97 
 
 		 586 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.79 
 
 		 827 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.51 
 
 		 811 aa  330  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  39.34 
 
 		 578 aa  324  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.83 
 
 		 814 aa  324  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.69 
 
 		 599 aa  323  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.05 
 
 		 578 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.4 
 
 		 785 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.41 
 
 		 907 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  34.83 
 
 		 932 aa  311  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.62 
 
 		 788 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.45 
 
 		 798 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  36.4 
 
 		 577 aa  300  5e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  36.4 
 
 		 577 aa  300  5e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  36.4 
 
 		 577 aa  300  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.62 
 
 		 576 aa  300  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  36.4 
 
 		 577 aa  299  8e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  36.4 
 
 		 577 aa  299  9e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  36.4 
 
 		 577 aa  299  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  36.4 
 
 		 577 aa  299  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.4 
 
 		 564 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.22 
 
 		 577 aa  298  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  36.22 
 
 		 577 aa  297  4e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.54 
 
 		 573 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  36.04 
 
 		 577 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  36.22 
 
 		 577 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  36.04 
 
 		 577 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.54 
 
 		 573 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3310  ssDNA exonuclease RecJ  36.04 
 
 		 577 aa  293  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.24828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  33.85 
 
 		 566 aa  294  4e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  36.04 
 
 		 577 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  36.04 
 
 		 577 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.22 
 
 		 773 aa  293  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  37.26 
 
 		 566 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.8 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.36 
 
 		 580 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  35.63 
 
 		 577 aa  289  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.73 
 
 		 885 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  35.45 
 
 		 577 aa  288  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.333614 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  35.45 
 
 		 577 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  35.27 
 
 		 577 aa  288  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.99 
 
 		 574 aa  286  5e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.99 
 
 		 574 aa  286  7e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.46 
 
 		 570 aa  286  8e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.25 
 
 		 571 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.25 
 
 		 779 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.25 
 
 		 779 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.94 
 
 		 779 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  35.28 
 
 		 684 aa  284  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.71 
 
 		 779 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_0897  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.4 
 
 		 574 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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