More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2989 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  73.19 
 
 		 597 aa  735    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.27 
 
 		 610 aa  647    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  72.99 
 
 		 605 aa  783    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
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NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  93.29 
 
 		 611 aa  1022    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 611 aa  1175    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.907848 
 
 
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NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  72.85 
 
 		 597 aa  739    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
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NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  98.53 
 
 		 611 aa  1158    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.78 
 
 		 603 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.54 
 
 		 613 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.23 
 
 		 633 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
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NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.9 
 
 		 626 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.31 
 
 		 613 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
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NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  56.59 
 
 		 613 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
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NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.34 
 
 		 613 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.49 
 
 		 600 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  56.42 
 
 		 613 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.88 
 
 		 600 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
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NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.32 
 
 		 613 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.28 
 
 		 603 aa  557  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
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NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.98 
 
 		 594 aa  552  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.96 
 
 		 594 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.41 
 
 		 594 aa  549  1e-155  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  53 
 
 		 600 aa  547  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  53.56 
 
 		 594 aa  544  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.61 
 
 		 575 aa  537  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.07 
 
 		 600 aa  510  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
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NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.1 
 
 		 580 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.16 
 
 		 603 aa  481  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  48.82 
 
 		 606 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.91 
 
 		 588 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.52 
 
 		 583 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
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NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  51.26 
 
 		 583 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.59 
 
 		 589 aa  461  9.999999999999999e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.26 
 
 		 583 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.97 
 
 		 594 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  48.56 
 
 		 585 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.96 
 
 		 579 aa  453  1.0000000000000001e-126  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  40.71 
 
 		 584 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.15 
 
 		 603 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
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NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.55 
 
 		 573 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.62 
 
 		 582 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
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NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.5 
 
 		 619 aa  432  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
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NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.53 
 
 		 605 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.98 
 
 		 588 aa  414  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.858016 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  41.76 
 
 		 592 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.3 
 
 		 577 aa  387  1e-106  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.16 
 
 		 586 aa  333  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.09 
 
 		 599 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.36 
 
 		 574 aa  317  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.07 
 
 		 568 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.92 
 
 		 573 aa  313  7.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.03 
 
 		 578 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.85 
 
 		 811 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.56 
 
 		 885 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.37 
 
 		 788 aa  297  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.29 
 
 		 564 aa  297  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_006368  lpp1417  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.44 
 
 		 579 aa  296  8e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006369  lpl1567  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.26 
 
 		 579 aa  296  9e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.13 
 
 		 573 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.58 
 
 		 569 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.65 
 
 		 907 aa  293  6e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.89 
 
 		 573 aa  293  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.45 
 
 		 798 aa  291  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  35.27 
 
 		 574 aa  290  5.0000000000000004e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.27 
 
 		 574 aa  290  6e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  37.54 
 
 		 569 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
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NC_011901  Tgr7_1460  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.53 
 
 		 574 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.83 
 
 		 831 aa  287  5e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.92 
 
 		 732 aa  286  8e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  37.1 
 
 		 577 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  37.1 
 
 		 577 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  33.68 
 
 		 932 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  37.1 
 
 		 577 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.1 
 
 		 571 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_1057  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.96 
 
 		 574 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  37.1 
 
 		 577 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.26 
 
 		 571 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  37.1 
 
 		 577 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  36.81 
 
 		 577 aa  284  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  36.81 
 
 		 577 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  36.81 
 
 		 577 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.98 
 
 		 827 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_3376  exonuclease RecJ  39.1 
 
 		 569 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.593595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.39 
 
 		 587 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.69 
 
 		 569 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.64 
 
 		 577 aa  283  9e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  36.81 
 
 		 577 aa  283  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.17 
 
 		 574 aa  282  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  38.45 
 
 		 571 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
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NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  36.64 
 
 		 577 aa  282  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  36.64 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.13 
 
 		 1035 aa  281  3e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  36.64 
 
 		 577 aa  281  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  36.64 
 
 		 577 aa  281  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.45 
 
 		 785 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1819  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.68 
 
 		 577 aa  280  4e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.46 
 
 		 573 aa  280  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.95 
 
 		 814 aa  279  9e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.44 
 
 		 569 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_2272  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.43 
 
 		 577 aa  277  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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