More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0860 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2554  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  60.32 
 
 		 723 aa  788    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495127  normal  1 
 
 
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NC_013946  Mrub_0860  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 644 aa  1278    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1599  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.02 
 
 		 702 aa  404  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.86 
 
 		 814 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.98 
 
 		 885 aa  296  9e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.66 
 
 		 801 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.73 
 
 		 811 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.74 
 
 		 907 aa  273  6e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.57 
 
 		 827 aa  269  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.99 
 
 		 574 aa  266  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.18 
 
 		 798 aa  266  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.83 
 
 		 566 aa  265  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.42 
 
 		 566 aa  263  8e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  37.4 
 
 		 592 aa  262  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.47 
 
 		 977 aa  261  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.22 
 
 		 574 aa  262  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.1 
 
 		 573 aa  260  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.02 
 
 		 587 aa  259  9e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.4 
 
 		 883 aa  259  1e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.79 
 
 		 989 aa  258  3e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.94 
 
 		 579 aa  258  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.07 
 
 		 566 aa  257  4e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
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NC_007513  Syncc9902_1157  RecJ exonuclease  36.05 
 
 		 632 aa  257  4e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.884679  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0519  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.52 
 
 		 1120 aa  256  6e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.388344  hitchhiker  0.00158278 
 
 
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NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.77 
 
 		 911 aa  256  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.92 
 
 		 578 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.86 
 
 		 573 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  33.92 
 
 		 578 aa  253  7e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 586 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.9 
 
 		 574 aa  249  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.52 
 
 		 599 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.1 
 
 		 583 aa  249  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.91 
 
 		 732 aa  248  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.86 
 
 		 568 aa  248  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 655 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 655 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008820  P9303_14521  Serine/threonine specific protein phosphatase  35.29 
 
 		 632 aa  247  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.23 
 
 		 955 aa  246  9e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  35.73 
 
 		 932 aa  246  9e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_007516  Syncc9605_1318  exonuclease RecJ  35.49 
 
 		 618 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0453835 
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.69 
 
 		 572 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.7 
 
 		 564 aa  244  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_3186  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.25 
 
 		 846 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28913  normal  1 
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.45 
 
 		 570 aa  244  3.9999999999999997e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.46 
 
 		 568 aa  244  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.29 
 
 		 569 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  30.89 
 
 		 756 aa  243  6e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.87 
 
 		 572 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_002620  TC0732  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.42 
 
 		 582 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.213373  n/a   
 
 
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NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.31 
 
 		 577 aa  241  2.9999999999999997e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.87 
 
 		 654 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.34 
 
 		 955 aa  241  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4538  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.58 
 
 		 813 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.954569 
 
 
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NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.86 
 
 		 573 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 779 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 779 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.18 
 
 		 573 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.92 
 
 		 773 aa  237  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.71 
 
 		 571 aa  238  4e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 779 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_1070  single-stranded DNA-specific exonuclease  32.4 
 
 		 622 aa  237  6e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.79 
 
 		 779 aa  236  7e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36 
 
 		 573 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30 
 
 		 568 aa  236  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 779 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 779 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009976  P9211_09101  single-stranded DNA-specific exonuclease  31.13 
 
 		 625 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188211 
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.08 
 
 		 564 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.46 
 
 		 779 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  32.75 
 
 		 779 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  33.27 
 
 		 779 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.53 
 
 		 570 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_1817  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.58 
 
 		 585 aa  233  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0771206 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 779 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008819  NATL1_10381  DHH domain-containing protein  30.83 
 
 		 629 aa  233  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112269 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0357  exonuclease RecJ  30.63 
 
 		 622 aa  233  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.5723  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.53 
 
 		 831 aa  232  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.56 
 
 		 573 aa  232  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.84 
 
 		 857 aa  232  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.69 
 
 		 1102 aa  231  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0138959 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  32.97 
 
 		 579 aa  231  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.99 
 
 		 864 aa  230  6e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.5 
 
 		 788 aa  230  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.97 
 
 		 579 aa  230  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  33.98 
 
 		 684 aa  229  8e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.65 
 
 		 579 aa  229  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.11 
 
 		 763 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.38 
 
 		 1035 aa  227  6e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.82 
 
 		 573 aa  226  9e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  32.98 
 
 		 577 aa  226  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 577 aa  225  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 577 aa  225  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.6 
 
 		 785 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  33.27 
 
 		 577 aa  225  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 577 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  33.27 
 
 		 577 aa  225  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 577 aa  224  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  33.7 
 
 		 571 aa  224  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.64 
 
 		 603 aa  224  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 577 aa  223  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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