More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2554 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0860  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  64.41 
 
 		 644 aa  788    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014212  Mesil_2554  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 723 aa  1435    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495127  normal  1 
 
 
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NC_008025  Dgeo_1599  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.41 
 
 		 702 aa  425  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.05 
 
 		 814 aa  300  9e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.12 
 
 		 827 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.78 
 
 		 885 aa  272  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.45 
 
 		 907 aa  272  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.98 
 
 		 566 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.59 
 
 		 801 aa  270  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.57 
 
 		 811 aa  267  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.95 
 
 		 977 aa  266  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.69 
 
 		 883 aa  265  2e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 566 aa  264  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  33.45 
 
 		 566 aa  263  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.67 
 
 		 572 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.34 
 
 		 654 aa  257  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.95 
 
 		 579 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.68 
 
 		 989 aa  255  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.89 
 
 		 599 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.06 
 
 		 587 aa  253  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  35.68 
 
 		 684 aa  252  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.32 
 
 		 911 aa  252  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.85 
 
 		 578 aa  251  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.37 
 
 		 572 aa  250  7e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 570 aa  249  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.41 
 
 		 574 aa  248  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.35 
 
 		 798 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 573 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.56 
 
 		 603 aa  245  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.24 
 
 		 583 aa  245  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008820  P9303_14521  Serine/threonine specific protein phosphatase  34.95 
 
 		 632 aa  245  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.28 
 
 		 573 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.85 
 
 		 655 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.85 
 
 		 655 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_3186  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.46 
 
 		 846 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28913  normal  1 
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.89 
 
 		 732 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.8 
 
 		 788 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  32.18 
 
 		 932 aa  244  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.17 
 
 		 573 aa  244  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  34.21 
 
 		 742 aa  243  9e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.02 
 
 		 564 aa  242  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.62 
 
 		 570 aa  242  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.59 
 
 		 569 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.62 
 
 		 568 aa  241  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.64 
 
 		 574 aa  241  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.58 
 
 		 573 aa  240  5.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.02 
 
 		 574 aa  239  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_007335  PMN2A_0357  exonuclease RecJ  32.67 
 
 		 622 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.5723  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  33.73 
 
 		 578 aa  239  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 579 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008312  Tery_4190  exonuclease RecJ  31.58 
 
 		 701 aa  239  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  33.28 
 
 		 592 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_008819  NATL1_10381  DHH domain-containing protein  32.26 
 
 		 629 aa  236  8e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112269 
 
 
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NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.58 
 
 		 579 aa  236  8e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
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NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  32.69 
 
 		 756 aa  236  8e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.16 
 
 		 568 aa  236  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.86 
 
 		 586 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.93 
 
 		 574 aa  236  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.93 
 
 		 574 aa  236  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4538  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.62 
 
 		 813 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.954569 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  33.16 
 
 		 579 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  33.81 
 
 		 577 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  33.81 
 
 		 577 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  33.81 
 
 		 577 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.07 
 
 		 576 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1318  exonuclease RecJ  35.67 
 
 		 618 aa  234  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0453835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.18 
 
 		 568 aa  234  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.06 
 
 		 573 aa  234  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  33.81 
 
 		 577 aa  233  7.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  33.81 
 
 		 577 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007513  Syncc9902_1157  RecJ exonuclease  34.73 
 
 		 632 aa  233  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.884679  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  33.63 
 
 		 577 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  35.49 
 
 		 569 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.5 
 
 		 785 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3592  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.6 
 
 		 696 aa  233  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.800679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.25 
 
 		 573 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.15 
 
 		 564 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  33.81 
 
 		 577 aa  233  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.61 
 
 		 569 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0519  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.72 
 
 		 1120 aa  233  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.388344  hitchhiker  0.00158278 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.45 
 
 		 577 aa  232  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.49 
 
 		 773 aa  232  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.97 
 
 		 779 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.97 
 
 		 779 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.05 
 
 		 763 aa  232  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  33.45 
 
 		 577 aa  232  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.47 
 
 		 955 aa  231  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.51 
 
 		 779 aa  231  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  33.81 
 
 		 577 aa  231  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  33.81 
 
 		 577 aa  231  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
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NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.26 
 
 		 569 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
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NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.26 
 
 		 569 aa  230  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  33.99 
 
 		 577 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
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NC_002620  TC0732  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.18 
 
 		 582 aa  230  7e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.213373  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  33.81 
 
 		 577 aa  230  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  35.78 
 
 		 571 aa  230  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
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NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  33.81 
 
 		 577 aa  230  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009976  P9211_09101  single-stranded DNA-specific exonuclease  29.07 
 
 		 625 aa  230  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188211 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.09 
 
 		 569 aa  230  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.07 
 
 		 831 aa  229  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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