47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0289 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  816    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  41.93 
 
 
405 aa  299  7e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  40.76 
 
 
408 aa  291  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  40.94 
 
 
405 aa  286  4e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  45.77 
 
 
402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  29.93 
 
 
427 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  27.48 
 
 
461 aa  160  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  29.34 
 
 
437 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  30.09 
 
 
452 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.45 
 
 
466 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  26.4 
 
 
469 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  26.23 
 
 
477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  25.62 
 
 
492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  25.22 
 
 
459 aa  121  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  27.21 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  24.57 
 
 
500 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  35.34 
 
 
515 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  23.26 
 
 
432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  25.25 
 
 
431 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  27.41 
 
 
465 aa  106  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  34.27 
 
 
473 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  25.97 
 
 
468 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  26.42 
 
 
466 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  24.45 
 
 
431 aa  99.8  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  23.96 
 
 
431 aa  99.8  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  26.04 
 
 
420 aa  98.6  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  25.54 
 
 
468 aa  94  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  24.17 
 
 
465 aa  90.5  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  25.61 
 
 
465 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  23.58 
 
 
468 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  23.17 
 
 
473 aa  77  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  22.87 
 
 
467 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  23.39 
 
 
467 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  23.06 
 
 
467 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  29.34 
 
 
467 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  26.83 
 
 
566 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.94 
 
 
857 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.22 
 
 
785 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1599  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.8 
 
 
702 aa  46.6  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.62 
 
 
611 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.62 
 
 
611 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  24.9 
 
 
606 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.38 
 
 
566 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.12 
 
 
611 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.907848 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.4 
 
 
865 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.18 
 
 
571 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2081  RecJ exonuclease  23.84 
 
 
537 aa  42.7  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>