124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1116 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 		 477 aa  972    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.39 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  47.31 
 
 		 461 aa  425  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  45.91 
 
 		 469 aa  424  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  39.59 
 
 		 492 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  40.52 
 
 		 500 aa  354  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  40.5 
 
 		 473 aa  347  4e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  39.54 
 
 		 515 aa  338  9.999999999999999e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  40.75 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  37.9 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  35.88 
 
 		 465 aa  257  3e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  34.5 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  35.07 
 
 		 465 aa  250  4e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  34.71 
 
 		 466 aa  243  7e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  36.15 
 
 		 467 aa  227  4e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  36.4 
 
 		 467 aa  226  6e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  35.59 
 
 		 467 aa  226  8e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  35.54 
 
 		 427 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  33.89 
 
 		 468 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  33.89 
 
 		 431 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  34.3 
 
 		 431 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  34.99 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  34.86 
 
 		 467 aa  210  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  33.75 
 
 		 431 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  31.81 
 
 		 437 aa  208  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  31.37 
 
 		 473 aa  206  8e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  34.47 
 
 		 465 aa  187  4e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  32.78 
 
 		 432 aa  186  6e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
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NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  30.97 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  29.77 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  26.23 
 
 		 399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  26.39 
 
 		 405 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  25.54 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  24.25 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  22.91 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.22 
 
 		 592 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.21 
 
 		 1035 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.43 
 
 		 883 aa  55.1  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0952  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.9 
 
 		 574 aa  53.5  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.78 
 
 		 592 aa  53.5  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4190  exonuclease RecJ  28.06 
 
 		 701 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2737  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28 
 
 		 574 aa  53.5  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.11 
 
 		 571 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.34 
 
 		 811 aa  53.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_03407  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32 
 
 		 573 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009976  P9211_09101  single-stranded DNA-specific exonuclease  25.62 
 
 		 625 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188211 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0892  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.93 
 
 		 584 aa  51.6  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.488933  n/a   
 
 
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NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  25 
 
 		 756 aa  51.2  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.55 
 
 		 571 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A0212  hypothetical protein  42.11 
 
 		 335 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.71 
 
 		 907 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3226  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.32 
 
 		 574 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3329  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.32 
 
 		 574 aa  50.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.74 
 
 		 574 aa  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.32 
 
 		 574 aa  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011663  Sbal223_3447  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.73 
 
 		 574 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.47 
 
 		 779 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  31.38 
 
 		 577 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  31.38 
 
 		 577 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.333614 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  30.58 
 
 		 577 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.31 
 
 		 569 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.39 
 
 		 655 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.47 
 
 		 779 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  23.47 
 
 		 779 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  23.47 
 
 		 779 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.47 
 
 		 779 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.31 
 
 		 569 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.74 
 
 		 569 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.47 
 
 		 779 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.39 
 
 		 655 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.47 
 
 		 779 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.74 
 
 		 569 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.47 
 
 		 779 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2065  exonuclease RecJ  30.94 
 
 		 564 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0845  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.18 
 
 		 577 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3522  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.18 
 
 		 577 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3641  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.18 
 
 		 577 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0772  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.18 
 
 		 574 aa  48.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167693  hitchhiker  0.00446395 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  30.43 
 
 		 566 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0749  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.27 
 
 		 574 aa  47.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0015193  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  27.87 
 
 		 574 aa  47.4  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0665  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.41 
 
 		 574 aa  47  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0729862  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  28.48 
 
 		 932 aa  47  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.67 
 
 		 763 aa  47  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3760  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.73 
 
 		 610 aa  47  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.671236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23 
 
 		 779 aa  47  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23 
 
 		 779 aa  47  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0519  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.51 
 
 		 1120 aa  46.2  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.388344  hitchhiker  0.00158278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.16 
 
 		 569 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  27.59 
 
 		 571 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0647  ssDNA exonuclease RecJ  30.54 
 
 		 584 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.252802  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.7 
 
 		 572 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  22.54 
 
 		 773 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  26.67 
 
 		 581 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.97 
 
 		 576 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.91 
 
 		 580 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3186  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.36 
 
 		 846 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28913  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.29 
 
 		 785 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.33 
 
 		 574 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.53 
 
 		 654 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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