45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1375 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 		 420 aa  846    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  32.03 
 
 		 461 aa  203  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.03 
 
 		 466 aa  193  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  31.25 
 
 		 452 aa  180  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  29.37 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  29.77 
 
 		 477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  31.11 
 
 		 431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  30.21 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  28.25 
 
 		 437 aa  156  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  29.89 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  26.53 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  30.68 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  30.23 
 
 		 459 aa  147  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  29.56 
 
 		 473 aa  145  9e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  26.3 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  28.88 
 
 		 469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  26.48 
 
 		 492 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  26.37 
 
 		 515 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  26.04 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  28.57 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  24.42 
 
 		 468 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  24.82 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  24.89 
 
 		 466 aa  99.8  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  26.04 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  24.15 
 
 		 468 aa  93.2  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  27.37 
 
 		 467 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  27.81 
 
 		 467 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  27.37 
 
 		 467 aa  90.1  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  25.99 
 
 		 467 aa  90.1  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  26.57 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  24.45 
 
 		 465 aa  88.2  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  24.27 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  23.89 
 
 		 465 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  23.53 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  26.11 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1098  phosphoesterase DHHA1  50 
 
 		 380 aa  53.5  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.99 
 
 		 619 aa  50.4  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0016  hypothetical protein  44.9 
 
 		 325 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.054001  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0709  phosphoesterase domain-containing protein  39.44 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0643  phosphoesterase domain-containing protein  32.26 
 
 		 351 aa  47.4  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0245262  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1429  phosphoesterase domain-containing protein  38.03 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.5 
 
 		 610 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1246  phosphoesterase domain-containing protein  38.03 
 
 		 335 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.81 
 
 		 535 aa  43.5  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2554  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.93 
 
 		 723 aa  43.5  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>