40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3679 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  67.91 
 
 
492 aa  651    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 
500 aa  999    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  75.38 
 
 
515 aa  720    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  68.41 
 
 
473 aa  634  1e-180  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  63.38 
 
 
469 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.2 
 
 
466 aa  437  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  45.2 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  47.39 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  40.31 
 
 
477 aa  358  9.999999999999999e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  39.71 
 
 
468 aa  293  5e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  36.23 
 
 
468 aa  264  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  37.63 
 
 
465 aa  261  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  34.59 
 
 
466 aa  252  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  35.7 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  32.55 
 
 
467 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  32.02 
 
 
467 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  32.86 
 
 
427 aa  210  6e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  31.81 
 
 
467 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  31.51 
 
 
468 aa  199  9e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  32.51 
 
 
467 aa  197  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  30.42 
 
 
431 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  30.63 
 
 
431 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  30.8 
 
 
437 aa  187  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  30.83 
 
 
431 aa  187  5e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  31.86 
 
 
452 aa  176  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  28.75 
 
 
473 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  27.47 
 
 
432 aa  168  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  27.73 
 
 
465 aa  155  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  26.23 
 
 
459 aa  150  6e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  26.25 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  25.05 
 
 
399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  27.12 
 
 
405 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  25.95 
 
 
405 aa  96.7  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  24.68 
 
 
408 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  32.92 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  25.77 
 
 
684 aa  51.6  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0016  hypothetical protein  27.54 
 
 
325 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.054001  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.68 
 
 
814 aa  44.3  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  27.38 
 
 
932 aa  44.3  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.19 
 
 
654 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>