57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1059 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  67.91 
 
 
500 aa  637    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 
492 aa  975    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  68.03 
 
 
469 aa  626  1e-178  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  65.28 
 
 
515 aa  613  9.999999999999999e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  67.76 
 
 
473 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.09 
 
 
466 aa  434  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  47.33 
 
 
461 aa  423  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  48.02 
 
 
469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  39.59 
 
 
477 aa  356  3.9999999999999996e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  39.83 
 
 
468 aa  290  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  37.3 
 
 
468 aa  264  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  38.45 
 
 
465 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  37.01 
 
 
466 aa  256  9e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  36.83 
 
 
465 aa  229  9e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  34.71 
 
 
427 aa  223  6e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  32.55 
 
 
467 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  31.85 
 
 
467 aa  220  5e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  32.35 
 
 
467 aa  220  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  32.26 
 
 
468 aa  209  6e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  32.29 
 
 
467 aa  205  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  33.13 
 
 
452 aa  205  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  29.33 
 
 
473 aa  176  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  30.02 
 
 
437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  28.77 
 
 
431 aa  161  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  30.32 
 
 
465 aa  160  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  28.66 
 
 
431 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  28.66 
 
 
431 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  27.84 
 
 
432 aa  155  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  26.32 
 
 
459 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  26.48 
 
 
420 aa  136  7.000000000000001e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  25.62 
 
 
399 aa  121  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  28.32 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  28.12 
 
 
405 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  25.76 
 
 
408 aa  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  33 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.65 
 
 
989 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.52 
 
 
814 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  25.48 
 
 
566 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.19 
 
 
566 aa  50.4  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.88 
 
 
570 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1865  phosphoesterase DHHA1  30.36 
 
 
311 aa  47.4  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.955345  normal  0.780671 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.79 
 
 
955 aa  47.4  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.3 
 
 
955 aa  46.6  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0860  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.19 
 
 
644 aa  46.6  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.19 
 
 
573 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.71 
 
 
566 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0519  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.04 
 
 
1120 aa  45.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.388344  hitchhiker  0.00158278 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1398  phosphoesterase, DHHA1  30.36 
 
 
311 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.2 
 
 
811 aa  45.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.85 
 
 
857 aa  45.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0709  phosphoesterase domain-containing protein  29.89 
 
 
338 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1032  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  22.05 
 
 
564 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.4 
 
 
574 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0825  exonuclease RecJ  24.73 
 
 
772 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.356276 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3226  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.4 
 
 
574 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.57 
 
 
1122 aa  43.9  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2554  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.7 
 
 
723 aa  43.5  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495127  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>