37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1347 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  960    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  58.01 
 
 
466 aa  522  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  56.62 
 
 
468 aa  524  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  56.84 
 
 
465 aa  510  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  50.64 
 
 
468 aa  464  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  35.07 
 
 
477 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.65 
 
 
466 aa  265  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  35.38 
 
 
461 aa  264  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  35.65 
 
 
469 aa  257  3e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  38.7 
 
 
469 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  35.86 
 
 
500 aa  249  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  36.83 
 
 
492 aa  247  4e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  37.66 
 
 
473 aa  244  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  35.83 
 
 
515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  31.52 
 
 
427 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  30.02 
 
 
467 aa  153  7e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  30.28 
 
 
467 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  29.94 
 
 
467 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  29.11 
 
 
452 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  29.25 
 
 
468 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  29.77 
 
 
467 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  28.04 
 
 
437 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  30.4 
 
 
473 aa  141  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  26.11 
 
 
465 aa  138  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  28.12 
 
 
431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  27.68 
 
 
431 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  27.12 
 
 
431 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  27.41 
 
 
399 aa  124  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  26 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  24.45 
 
 
420 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  26.16 
 
 
459 aa  100  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  26.58 
 
 
405 aa  96.3  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  26.89 
 
 
408 aa  86.7  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  25.66 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  29.95 
 
 
402 aa  51.6  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3674  phosphoesterase RecJ domain protein  30.2 
 
 
326 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  22.27 
 
 
736 aa  44.3  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>