57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2532 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 		 468 aa  958    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  64.71 
 
 		 466 aa  612  9.999999999999999e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  64.36 
 
 		 465 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  55.96 
 
 		 468 aa  533  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  56.62 
 
 		 465 aa  511  1e-144  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  40.08 
 
 		 492 aa  300  3e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.99 
 
 		 466 aa  299  9e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  37.82 
 
 		 477 aa  297  2e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  37.86 
 
 		 469 aa  296  6e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  39.67 
 
 		 500 aa  295  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  37.39 
 
 		 461 aa  293  4e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  41.24 
 
 		 473 aa  286  5.999999999999999e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  40.09 
 
 		 469 aa  280  3e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  36.05 
 
 		 515 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  31.75 
 
 		 467 aa  193  7e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  32.43 
 
 		 468 aa  189  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  31.98 
 
 		 467 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  31.76 
 
 		 467 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  32.24 
 
 		 473 aa  176  8e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  31.91 
 
 		 427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  30.39 
 
 		 467 aa  170  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  27.41 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  28.24 
 
 		 465 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  25.91 
 
 		 437 aa  133  9e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  27.27 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  26.23 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  26.44 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  24.52 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  24.31 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  25.76 
 
 		 399 aa  107  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  24.02 
 
 		 420 aa  97.4  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  27.68 
 
 		 405 aa  87.8  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  26.01 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  27.64 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.44 
 
 		 553 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4610  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.44 
 
 		 553 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.730402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.61 
 
 		 572 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0016  hypothetical protein  44 
 
 		 325 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.054001  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09101  single-stranded DNA-specific exonuclease  28.89 
 
 		 625 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188211 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.27 
 
 		 535 aa  47.8  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  25.95 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  28.8 
 
 		 756 aa  47.4  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2554  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.4 
 
 		 723 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  27.62 
 
 		 655 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.96 
 
 		 572 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.26 
 
 		 757 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.26 
 
 		 757 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1070  single-stranded DNA-specific exonuclease  29.05 
 
 		 622 aa  45.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0860  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.38 
 
 		 644 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.56 
 
 		 865 aa  44.3  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  29.24 
 
 		 736 aa  43.9  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1032  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.02 
 
 		 564 aa  43.9  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  25 
 
 		 566 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.96 
 
 		 583 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.19 
 
 		 610 aa  43.5  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.41 
 
 		 611 aa  43.1  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.907848 
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25 
 
 		 566 aa  43.1  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>