46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1509 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  100 
 
 		 473 aa  967    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  30.45 
 
 		 461 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  31.37 
 
 		 477 aa  230  3e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.06 
 
 		 466 aa  227  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  30.92 
 
 		 469 aa  218  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  32.97 
 
 		 469 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  32.44 
 
 		 473 aa  204  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  29.92 
 
 		 492 aa  196  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  28.84 
 
 		 500 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  32.35 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  28.26 
 
 		 515 aa  183  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  32.28 
 
 		 465 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  30.8 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  30.65 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  29.42 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  28.76 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  30.22 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  29.84 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  28.19 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  29.66 
 
 		 431 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  27.97 
 
 		 467 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  28.32 
 
 		 467 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  28.34 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  29.46 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  27.54 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  25.82 
 
 		 437 aa  133  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  26.48 
 
 		 468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  28.57 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  26.94 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  23.27 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  24.27 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  25.22 
 
 		 405 aa  104  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  24.24 
 
 		 405 aa  97.4  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  23.11 
 
 		 399 aa  90.9  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  23.68 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  25 
 
 		 736 aa  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  22.58 
 
 		 557 aa  49.3  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0436737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.05 
 
 		 592 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.52 
 
 		 592 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.74 
 
 		 603 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.78 
 
 		 611 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.22 
 
 		 864 aa  43.9  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.81 
 
 		 779 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.81 
 
 		 779 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  23.81 
 
 		 779 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  23.81 
 
 		 779 aa  43.1  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>