75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0121 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 		 427 aa  845    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  42.53 
 
 		 452 aa  340  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  39.86 
 
 		 437 aa  338  9e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.35 
 
 		 466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  37.47 
 
 		 469 aa  243  7e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  35.23 
 
 		 461 aa  236  8e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  34.71 
 
 		 492 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  35.54 
 
 		 477 aa  219  7e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  35.79 
 
 		 469 aa  212  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  32.92 
 
 		 500 aa  209  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  33.97 
 
 		 431 aa  209  7e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  33.11 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  33.53 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  32.43 
 
 		 431 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  35.45 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  34.35 
 
 		 473 aa  195  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  30.09 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  28.3 
 
 		 432 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  31.57 
 
 		 468 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  31.04 
 
 		 408 aa  169  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  29.93 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  31.53 
 
 		 465 aa  157  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  29.11 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  26.53 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  28.24 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  34.94 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  31.65 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  29.81 
 
 		 465 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  30.75 
 
 		 465 aa  130  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  29.68 
 
 		 467 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  29.22 
 
 		 467 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  28.86 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  25.97 
 
 		 473 aa  100  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  27.06 
 
 		 467 aa  97.1  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  26.39 
 
 		 468 aa  95.1  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  28.37 
 
 		 566 aa  67.8  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.04 
 
 		 566 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.09 
 
 		 566 aa  57  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.36 
 
 		 580 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.19 
 
 		 573 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.84 
 
 		 564 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2554  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.06 
 
 		 723 aa  53.5  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1599  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.77 
 
 		 702 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.39 
 
 		 610 aa  53.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.74 
 
 		 573 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1057  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.29 
 
 		 574 aa  51.2  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.88 
 
 		 573 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27 
 
 		 788 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.38 
 
 		 911 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.88 
 
 		 573 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.32 
 
 		 603 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.99 
 
 		 619 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.63 
 
 		 955 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.3 
 
 		 589 aa  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.06 
 
 		 582 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  24.88 
 
 		 584 aa  47  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  28.04 
 
 		 722 aa  46.6  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0860  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.37 
 
 		 644 aa  46.6  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  22.89 
 
 		 572 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.67 
 
 		 732 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.63 
 
 		 785 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1070  single-stranded DNA-specific exonuclease  21.82 
 
 		 622 aa  45.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.57 
 
 		 578 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.87 
 
 		 757 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26 
 
 		 955 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  25.24 
 
 		 594 aa  44.3  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  22.46 
 
 		 989 aa  43.9  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  28.28 
 
 		 600 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.5 
 
 		 757 aa  43.5  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.04 
 
 		 776 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.5 
 
 		 757 aa  43.5  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.04 
 
 		 776 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.340424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.88 
 
 		 611 aa  43.5  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.36 
 
 		 568 aa  43.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.59 
 
 		 865 aa  43.1  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>