58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2111 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  909    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  50.92 
 
 		 437 aa  488  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  42.53 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.55 
 
 		 466 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  34.78 
 
 		 469 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  34.99 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  34.1 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  32.69 
 
 		 461 aa  206  5e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  33.13 
 
 		 492 aa  205  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  32.96 
 
 		 431 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  34.04 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  32.22 
 
 		 432 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  33.85 
 
 		 459 aa  197  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  31.25 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  30.42 
 
 		 408 aa  176  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  32.22 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  32.91 
 
 		 469 aa  172  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  30.71 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  32.41 
 
 		 473 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  30.09 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  30.14 
 
 		 405 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  30.23 
 
 		 515 aa  153  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  30.42 
 
 		 468 aa  143  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  28.84 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  27.13 
 
 		 468 aa  133  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  29.11 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  35.24 
 
 		 402 aa  131  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  27.51 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  27.51 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  27.51 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  28.35 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  29.15 
 
 		 473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  29.54 
 
 		 465 aa  114  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  26.96 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  24.68 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0860  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.79 
 
 		 644 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2554  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.38 
 
 		 723 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.29 
 
 		 857 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1400  hypothetical protein  25.83 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  26.74 
 
 		 566 aa  47  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0724  putative exonuclease RecJ  23.66 
 
 		 382 aa  46.6  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1214  phosphoesterase RecJ domain protein  26.49 
 
 		 545 aa  46.2  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0990291  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.7 
 
 		 566 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1602  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.36 
 
 		 823 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.53 
 
 		 592 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2719  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.62 
 
 		 767 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.74 
 
 		 566 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.23 
 
 		 580 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  24.72 
 
 		 932 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.4 
 
 		 619 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2133  putative exonuclease RecJ  23.97 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.163507 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.04 
 
 		 779 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1599  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.67 
 
 		 702 aa  44.3  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  27.36 
 
 		 655 aa  43.9  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  27.4 
 
 		 594 aa  43.9  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  23.28 
 
 		 756 aa  43.5  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0016  hypothetical protein  32.35 
 
 		 325 aa  43.9  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.054001  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.01 
 
 		 582 aa  43.5  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>