24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0016 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0016  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  671    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.054001  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1398  phosphoesterase, DHHA1  39.81 
 
 
311 aa  211  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1865  phosphoesterase DHHA1  39.16 
 
 
311 aa  208  8e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.955345  normal  0.780671 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1518  phosphoesterase, DHHA1  41.04 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0862  phosphoesterase, DHHA1  38.76 
 
 
321 aa  196  7e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1098  phosphoesterase DHHA1  24.77 
 
 
380 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1526  DHH superfamily phosphohydrolase  25.15 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.390938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0259  phosphoesterase DHHA1  22.61 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  44.9 
 
 
420 aa  49.7  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  44 
 
 
468 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1366  hypothetical protein  21.32 
 
 
341 aa  47  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0940  hypothetical protein  20.52 
 
 
350 aa  46.2  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.532408  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0574  phosphoesterase domain-containing protein  24.91 
 
 
335 aa  46.2  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  40 
 
 
469 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  27.54 
 
 
500 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  32.35 
 
 
452 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  55.88 
 
 
459 aa  43.5  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.27 
 
 
466 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0462  DHH family protein  24.53 
 
 
321 aa  43.5  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1429  phosphoesterase domain-containing protein  33.68 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0709  phosphoesterase domain-containing protein  32.63 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0961  hypothetical protein  21.08 
 
 
348 aa  43.1  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.336205  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1094  hypothetical protein  20.83 
 
 
338 aa  42.7  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000271985  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0889  hypothetical protein  20.54 
 
 
348 aa  42.7  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>