63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1060 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  90.02 
 
 		 431 aa  787    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  93.74 
 
 		 431 aa  815    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 		 431 aa  868    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  65.05 
 
 		 432 aa  590  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  47.77 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.13 
 
 		 466 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  32.9 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  33.97 
 
 		 427 aa  209  8e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  33.75 
 
 		 477 aa  209  1e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  34.1 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  32.27 
 
 		 469 aa  207  4e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  30.45 
 
 		 437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  30.83 
 
 		 500 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  29.15 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  30.21 
 
 		 420 aa  160  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  28.66 
 
 		 492 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  29.69 
 
 		 473 aa  153  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  27.88 
 
 		 515 aa  139  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  27.27 
 
 		 468 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  28.04 
 
 		 466 aa  121  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  31.96 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  31.13 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  29.84 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  25.56 
 
 		 468 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  32.28 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  31.03 
 
 		 467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  30.98 
 
 		 468 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  26.79 
 
 		 465 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  23.13 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  25.25 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  25.56 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  24.27 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  24.86 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  26.3 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  25.34 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  22.35 
 
 		 932 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  21.75 
 
 		 573 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.39 
 
 		 1035 aa  53.5  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0888  phosphoesterase, RecJ-like protein  22.17 
 
 		 546 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2554  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.49 
 
 		 723 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2314  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.33 
 
 		 560 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.843202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.13 
 
 		 592 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  21.35 
 
 		 577 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  21.35 
 
 		 577 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.333614 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0618  exonuclease RecJ  30.06 
 
 		 810 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195781  decreased coverage  0.00316903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.84 
 
 		 885 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1341  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.03 
 
 		 719 aa  47.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  21.12 
 
 		 577 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  19.69 
 
 		 603 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1057  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.59 
 
 		 574 aa  46.6  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09101  single-stranded DNA-specific exonuclease  25.78 
 
 		 625 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188211 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.35 
 
 		 592 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4094  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  21.72 
 
 		 584 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4190  exonuclease RecJ  21.21 
 
 		 701 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.02 
 
 		 864 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.75 
 
 		 566 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.43 
 
 		 587 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0860  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.4 
 
 		 644 aa  44.3  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1032  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.32 
 
 		 564 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  27.11 
 
 		 566 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.4 
 
 		 569 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.32 
 
 		 654 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.22 
 
 		 989 aa  43.1  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>