54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1828 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 		 466 aa  960    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  64.71 
 
 		 468 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  63.62 
 
 		 465 aa  591  1e-168  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  56.6 
 
 		 468 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  57.88 
 
 		 465 aa  520  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  36.85 
 
 		 461 aa  288  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  36.29 
 
 		 469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.47 
 
 		 466 aa  280  5e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  37.01 
 
 		 492 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  38.84 
 
 		 473 aa  263  4e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  35.17 
 
 		 500 aa  263  4.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  34.71 
 
 		 477 aa  262  8.999999999999999e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  38.27 
 
 		 469 aa  260  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  32.23 
 
 		 515 aa  227  4e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  32.44 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  32.37 
 
 		 467 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  32.53 
 
 		 467 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  30.53 
 
 		 468 aa  172  9e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  30.58 
 
 		 473 aa  172  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  29.11 
 
 		 427 aa  167  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  31.72 
 
 		 467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  28.63 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  28.86 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  28.04 
 
 		 431 aa  142  9e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  25.89 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  28.51 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  27.37 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  26 
 
 		 432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  24.89 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  26.42 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  25.42 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  26.41 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  23.41 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  30.32 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2554  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.32 
 
 		 723 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  27.41 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4610  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.49 
 
 		 553 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.730402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.49 
 
 		 553 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  25.77 
 
 		 756 aa  45.8  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5831  phosphoesterase RecJ domain protein  26.21 
 
 		 336 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0452248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0844  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.09 
 
 		 559 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  25.4 
 
 		 779 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0848  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.09 
 
 		 559 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3601e-16 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.93 
 
 		 566 aa  44.7  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.4 
 
 		 779 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.4 
 
 		 779 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.4 
 
 		 779 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.4 
 
 		 773 aa  44.3  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  24.84 
 
 		 736 aa  44.3  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  25.4 
 
 		 779 aa  44.3  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.4 
 
 		 779 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0016  hypothetical protein  34.29 
 
 		 325 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.054001  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.4 
 
 		 779 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.4 
 
 		 779 aa  43.5  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>