76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0990 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  95.29 
 
 		 467 aa  900    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  71.24 
 
 		 468 aa  647    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  96.15 
 
 		 467 aa  909    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  84.58 
 
 		 467 aa  788    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 		 467 aa  951    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  35.59 
 
 		 477 aa  240  5e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.45 
 
 		 466 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  34.78 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  35.07 
 
 		 469 aa  236  7e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  32.55 
 
 		 492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  35.73 
 
 		 469 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  34.37 
 
 		 473 aa  231  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  32.98 
 
 		 500 aa  226  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  31.12 
 
 		 515 aa  206  7e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  32.13 
 
 		 468 aa  203  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  31.83 
 
 		 468 aa  186  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  32.37 
 
 		 466 aa  174  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  30.34 
 
 		 465 aa  170  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  30.28 
 
 		 465 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  29.68 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  27.51 
 
 		 452 aa  134  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  30.79 
 
 		 431 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  30.79 
 
 		 431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  31.03 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  26.82 
 
 		 473 aa  126  9e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  27.11 
 
 		 437 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  28.12 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  28.89 
 
 		 459 aa  117  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  29.04 
 
 		 432 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  27.37 
 
 		 420 aa  106  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  23.46 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  23.39 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  32.77 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0432  hypothetical protein  28.99 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.117115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.89 
 
 		 582 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0401  hypothetical protein  24.44 
 
 		 315 aa  55.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.116118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4610  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.41 
 
 		 553 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.730402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.41 
 
 		 553 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  24.07 
 
 		 405 aa  53.1  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2737  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.04 
 
 		 574 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.12 
 
 		 1102 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0138959 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.13 
 
 		 603 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2065  exonuclease RecJ  26.01 
 
 		 564 aa  51.2  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1248  phosphoesterase, RecJ-like  26.63 
 
 		 597 aa  50.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0768  phosphoesterase RecJ domain protein  27.44 
 
 		 557 aa  50.1  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  27.75 
 
 		 600 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1581  hypothetical protein  24.23 
 
 		 315 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126829  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  23.89 
 
 		 583 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.89 
 
 		 583 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0640  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.43 
 
 		 613 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  29.14 
 
 		 402 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0790  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.94 
 
 		 611 aa  46.2  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1032  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.93 
 
 		 564 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1602  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.2 
 
 		 823 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.61 
 
 		 611 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.46 
 
 		 557 aa  45.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0436737  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.12 
 
 		 611 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.907848 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1154  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.56 
 
 		 565 aa  44.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1098  phosphoesterase DHHA1  33.33 
 
 		 380 aa  44.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.74 
 
 		 579 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.37 
 
 		 955 aa  44.7  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0844  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.57 
 
 		 559 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  21.84 
 
 		 566 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0848  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.57 
 
 		 559 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3601e-16 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  23.12 
 
 		 565 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.26 
 
 		 955 aa  43.9  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.32 
 
 		 885 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1460  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.77 
 
 		 574 aa  43.9  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0511  hypothetical protein  24.61 
 
 		 206 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0331  hypothetical protein  22.81 
 
 		 317 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000516136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.34 
 
 		 583 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0733  exonuclease RecJ  26.15 
 
 		 608 aa  43.5  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2026  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.56 
 
 		 565 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2153  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.56 
 
 		 565 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000147893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.27 
 
 		 779 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.61 
 
 		 611 aa  43.1  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>