61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1566 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  91.42 
 
 		 431 aa  804    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 		 431 aa  867    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  90.02 
 
 		 431 aa  787    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  64.12 
 
 		 432 aa  589  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  48.55 
 
 		 459 aa  423  1e-117  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  33.41 
 
 		 461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.29 
 
 		 466 aa  219  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  33.89 
 
 		 477 aa  215  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  32.14 
 
 		 437 aa  206  6e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  32.27 
 
 		 469 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  34.04 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  32.43 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  30.42 
 
 		 500 aa  189  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  28.94 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  31.11 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  28.77 
 
 		 492 aa  161  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  29.85 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  28.08 
 
 		 515 aa  136  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  29.45 
 
 		 473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  31.67 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  31.18 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  32.09 
 
 		 467 aa  116  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  28.51 
 
 		 466 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  31.31 
 
 		 467 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  26.39 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  27.48 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  24.78 
 
 		 468 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  30.39 
 
 		 468 aa  108  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  25.99 
 
 		 465 aa  106  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  23.24 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  23.96 
 
 		 399 aa  99.8  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  25.21 
 
 		 405 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  29.73 
 
 		 465 aa  89  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  23.3 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  24.29 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.04 
 
 		 811 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2554  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.47 
 
 		 723 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.13 
 
 		 592 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.66 
 
 		 1035 aa  51.2  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.35 
 
 		 592 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0860  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.94 
 
 		 644 aa  50.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  21.35 
 
 		 577 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  21.6 
 
 		 577 aa  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  21.6 
 
 		 577 aa  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.333614 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  26.25 
 
 		 932 aa  48.9  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.9 
 
 		 566 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1057  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.68 
 
 		 574 aa  47.8  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2314  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.66 
 
 		 560 aa  47.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.843202  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1341  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.8 
 
 		 719 aa  47.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.5 
 
 		 885 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  27.11 
 
 		 566 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.54 
 
 		 776 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.54 
 
 		 776 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.340424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4190  exonuclease RecJ  21.73 
 
 		 701 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  25.28 
 
 		 684 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1755  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.59 
 
 		 530 aa  44.3  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  21.67 
 
 		 569 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.14 
 
 		 574 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4094  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.71 
 
 		 584 aa  43.9  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1474  single-strand DNA-specific exonuclease  24.1 
 
 		 573 aa  43.5  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.01 
 
 		 566 aa  43.1  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>