48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0514 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 		 465 aa  929    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  31.43 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.19 
 
 		 466 aa  196  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  30.59 
 
 		 469 aa  192  7e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  31.84 
 
 		 473 aa  190  5e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  29.98 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  28.21 
 
 		 492 aa  176  9e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  32.36 
 
 		 515 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  30.42 
 
 		 473 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  29.21 
 
 		 469 aa  162  9e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  26.34 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  27.83 
 
 		 468 aa  156  7e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  27.59 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  27.07 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  26 
 
 		 465 aa  141  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  28.95 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  25.5 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  25.07 
 
 		 468 aa  124  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  28.83 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  27.23 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  28.98 
 
 		 467 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  28.12 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  28.03 
 
 		 467 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  26.4 
 
 		 420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  27 
 
 		 432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  24.84 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  25.74 
 
 		 431 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  25.11 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  24.95 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  23.98 
 
 		 399 aa  93.2  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  24.22 
 
 		 405 aa  89.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  23.66 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  23.16 
 
 		 408 aa  79.7  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  21.72 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  24.12 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0860  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.8 
 
 		 644 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2554  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.8 
 
 		 723 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.11 
 
 		 603 aa  50.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.14 
 
 		 610 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  24.44 
 
 		 585 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.79 
 
 		 1035 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23 
 
 		 989 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.98 
 
 		 589 aa  44.7  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  23.38 
 
 		 584 aa  44.7  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.14 
 
 		 575 aa  44.3  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.14 
 
 		 594 aa  44.3  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.88 
 
 		 582 aa  43.9  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.96 
 
 		 583 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>