43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2276 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  100 
 
 		 468 aa  964    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  56.6 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  55.96 
 
 		 468 aa  520  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  53.02 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  50.43 
 
 		 465 aa  450  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  37.3 
 
 		 492 aa  264  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  37.79 
 
 		 473 aa  262  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  36.21 
 
 		 500 aa  262  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.05 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  35.57 
 
 		 469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  33.26 
 
 		 461 aa  252  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  34.5 
 
 		 477 aa  251  2e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  37.95 
 
 		 469 aa  246  6e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  34.52 
 
 		 515 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  31.83 
 
 		 467 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  31.83 
 
 		 467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  31.25 
 
 		 467 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  30.47 
 
 		 468 aa  170  5e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  31.23 
 
 		 473 aa  169  8e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  30.51 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  28.24 
 
 		 427 aa  151  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  30.42 
 
 		 452 aa  143  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  29.18 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  26.14 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  25.56 
 
 		 431 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  26.06 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  26.96 
 
 		 459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  24.78 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  24.78 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  24.42 
 
 		 420 aa  104  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  25.54 
 
 		 399 aa  94  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  23.94 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  30.09 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  34.91 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  28.43 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4610  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31 
 
 		 553 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.730402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31 
 
 		 553 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2554  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.26 
 
 		 723 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0519  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.98 
 
 		 1120 aa  47.4  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.388344  hitchhiker  0.00158278 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0848  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.53 
 
 		 559 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3601e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0844  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.53 
 
 		 559 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.47 
 
 		 535 aa  43.9  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1185  phosphoesterase domain-containing protein  28.3 
 
 		 364 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991694  normal  0.383627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>