40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1684 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  100 
 
 
465 aa  956    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  64.36 
 
 
468 aa  615  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  63.62 
 
 
466 aa  594  1e-168  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  56.84 
 
 
465 aa  510  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  53.23 
 
 
468 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  38.45 
 
 
492 aa  280  4e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  35.88 
 
 
477 aa  280  6e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  37.65 
 
 
500 aa  277  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.15 
 
 
466 aa  274  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  35.84 
 
 
461 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  35.53 
 
 
469 aa  263  4e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  38.68 
 
 
473 aa  257  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  37.8 
 
 
469 aa  256  5e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  34.83 
 
 
515 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  29.82 
 
 
467 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  30.34 
 
 
467 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  29.89 
 
 
467 aa  176  7e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  29.6 
 
 
468 aa  176  9e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  29.93 
 
 
467 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  29.46 
 
 
473 aa  161  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  29.81 
 
 
427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  28.35 
 
 
452 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  25.7 
 
 
437 aa  136  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  24.65 
 
 
465 aa  127  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  25.44 
 
 
431 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  25.99 
 
 
431 aa  123  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  25.28 
 
 
431 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  23.51 
 
 
459 aa  111  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  24.78 
 
 
432 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  25.61 
 
 
399 aa  97.1  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  23.89 
 
 
420 aa  90.5  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  27.21 
 
 
405 aa  84  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  23.66 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  29.46 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0844  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  22.34 
 
 
559 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0848  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  22.34 
 
 
559 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3601e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4610  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.29 
 
 
553 aa  47  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.730402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.29 
 
 
553 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  22.31 
 
 
584 aa  45.8  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2554  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.26 
 
 
723 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495127  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>