56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2340 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  100 
 
 
437 aa  878    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  50.92 
 
 
452 aa  488  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  39.86 
 
 
427 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.25 
 
 
466 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  31.59 
 
 
469 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  32.26 
 
 
461 aa  209  7e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  31.81 
 
 
477 aa  208  1e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  32.14 
 
 
431 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  33.69 
 
 
459 aa  204  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  30.27 
 
 
431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  30.45 
 
 
431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  31.37 
 
 
408 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  31.59 
 
 
500 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  30.09 
 
 
432 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  30.98 
 
 
405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  30.75 
 
 
469 aa  179  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  30.02 
 
 
492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  30.16 
 
 
515 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  29.34 
 
 
399 aa  159  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  28.25 
 
 
420 aa  156  6e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  30.84 
 
 
473 aa  156  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  30.64 
 
 
405 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  35.38 
 
 
402 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  25.67 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  28.04 
 
 
465 aa  126  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  26.14 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  25.89 
 
 
466 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  25.7 
 
 
465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  26.03 
 
 
473 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  27.11 
 
 
467 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  27.84 
 
 
467 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  26.95 
 
 
467 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  27.11 
 
 
467 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  26.75 
 
 
465 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  26.71 
 
 
468 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1599  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.64 
 
 
702 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.08 
 
 
619 aa  50.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2554  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.37 
 
 
723 aa  50.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495127  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0860  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.76 
 
 
644 aa  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.43 
 
 
580 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  21.71 
 
 
578 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.85 
 
 
611 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.67 
 
 
776 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.67 
 
 
776 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.340424  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0212  hypothetical protein  36.49 
 
 
335 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.49 
 
 
857 aa  44.3  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.27 
 
 
571 aa  43.9  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2081  RecJ exonuclease  29.63 
 
 
537 aa  43.9  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.18 
 
 
883 aa  43.9  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.66 
 
 
573 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.67 
 
 
611 aa  43.9  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.907848 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  26.85 
 
 
594 aa  43.5  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 
586 aa  43.5  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.04 
 
 
885 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.67 
 
 
611 aa  43.1  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  23.67 
 
 
566 aa  43.1  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>