More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6339 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6339  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 400 aa  808    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.69 
 
 		 364 aa  237  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.27 
 
 		 334 aa  233  5e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6279  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.79 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000172683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.17 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.17 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.17 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.8 
 
 		 346 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  35.82 
 
 		 356 aa  223  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2804  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.22 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.78 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.57 
 
 		 348 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  40 
 
 		 370 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.83 
 
 		 384 aa  215  9e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.27 
 
 		 355 aa  215  9e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  40.67 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.97 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.48 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.11 
 
 		 361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14420  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  41.52 
 
 		 356 aa  212  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0770  tartrate dehydrogenase  39.14 
 
 		 359 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144909 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.14 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1445  tartrate dehydrogenase  39.32 
 
 		 358 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.75 
 
 		 374 aa  209  8e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.97 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.84 
 
 		 358 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.64 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  38.16 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.87 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.86 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6783  tartrate dehydrogenase  39.14 
 
 		 358 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4658  tartrate dehydrogenase  37.71 
 
 		 358 aa  206  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77852 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  34.15 
 
 		 337 aa  206  7e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  35.08 
 
 		 359 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.53 
 
 		 357 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1616  tartrate dehydrogenase  32.99 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.409343  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.17 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.41 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  32.99 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1512  tartrate dehydrogenase  32.99 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.84 
 
 		 375 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  33.68 
 
 		 363 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.29 
 
 		 358 aa  204  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  35.89 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.85 
 
 		 350 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1632  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.65 
 
 		 375 aa  203  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.341727  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.84 
 
 		 375 aa  202  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0489  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.72 
 
 		 388 aa  202  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  37.21 
 
 		 363 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.29 
 
 		 371 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.59 
 
 		 374 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  36.24 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  36.24 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.31 
 
 		 343 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0442  tartrate dehydrogenase  35.75 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  35.62 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  36.24 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  36.61 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.98 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.05 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  35.44 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.5 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  37.05 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.45 
 
 		 478 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5655  tartrate dehydrogenase  35.66 
 
 		 360 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  34.28 
 
 		 361 aa  199  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5025  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.24 
 
 		 347 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.70387 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0013  tartrate dehydrogenase  35.71 
 
 		 361 aa  199  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04003  tartrate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04150)  35.07 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.538835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.5 
 
 		 353 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.24 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3393  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.64 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  37.05 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0996  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  36.68 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.0127706 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  36.45 
 
 		 335 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  33.42 
 
 		 361 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  36.21 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  36.21 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  38.7 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.38 
 
 		 355 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  36.45 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  33.42 
 
 		 361 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  36.21 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  34.55 
 
 		 360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  38 
 
 		 348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.97 
 
 		 352 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0498293 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  36.59 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  33.69 
 
 		 361 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  35.15 
 
 		 361 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  36.21 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  33.42 
 
 		 361 aa  196  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  33.42 
 
 		 361 aa  196  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  33.42 
 
 		 361 aa  196  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  37.14 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  33.42 
 
 		 361 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.18 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  37.28 
 
 		 335 aa  196  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  33.42 
 
 		 361 aa  196  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4654  tartrate dehydrogenase  35.98 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  33.42 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>