104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4399 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4399  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 700 aa  1342    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.25 
 
 		 1553 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1510 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  27.92 
 
 		 1190 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.94 
 
 		 1557 aa  71.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  24.13 
 
 		 1367 aa  71.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.98 
 
 		 1481 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1807 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.91 
 
 		 1193 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  23.87 
 
 		 1364 aa  68.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.06 
 
 		 696 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  26.63 
 
 		 1399 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.83 
 
 		 1161 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  22.83 
 
 		 1161 aa  64.3  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  25.74 
 
 		 1280 aa  63.9  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  24.95 
 
 		 1211 aa  62.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.91 
 
 		 1901 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  26.67 
 
 		 742 aa  62  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  21.47 
 
 		 1196 aa  61.6  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  20.76 
 
 		 1163 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  21.77 
 
 		 1831 aa  60.1  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.65 
 
 		 1684 aa  58.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  25.51 
 
 		 1484 aa  57.4  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.86 
 
 		 642 aa  57.4  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.47 
 
 		 930 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.91 
 
 		 677 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.95 
 
 		 919 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  22.17 
 
 		 728 aa  54.3  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  21.41 
 
 		 1236 aa  54.3  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  20.47 
 
 		 1363 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  25.12 
 
 		 1357 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  22.97 
 
 		 346 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 1221 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25.18 
 
 		 1214 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  22.87 
 
 		 1247 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  26.76 
 
 		 1213 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.04 
 
 		 1623 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.61 
 
 		 1617 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.73 
 
 		 1205 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  25.84 
 
 		 1209 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.64 
 
 		 1599 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  27.65 
 
 		 1416 aa  51.2  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  23.46 
 
 		 1766 aa  50.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.66 
 
 		 608 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  26.67 
 
 		 464 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.36 
 
 		 1004 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.72 
 
 		 1607 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  28.7 
 
 		 565 aa  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  21.9 
 
 		 1242 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  22.46 
 
 		 1188 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.98 
 
 		 1454 aa  50.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.13 
 
 		 740 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  22.65 
 
 		 1176 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 		 636 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.4 
 
 		 596 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  25.87 
 
 		 540 aa  48.5  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  20.66 
 
 		 947 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 		 687 aa  48.1  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  25.37 
 
 		 578 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  24.88 
 
 		 1661 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.18 
 
 		 842 aa  47.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  28.26 
 
 		 317 aa  47.4  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  32.38 
 
 		 1334 aa  47.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  30.89 
 
 		 342 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.39 
 
 		 1711 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.21 
 
 		 1039 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.35 
 
 		 1609 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.44 
 
 		 1686 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.56 
 
 		 1240 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  21.91 
 
 		 1190 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1041 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  20.92 
 
 		 1330 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.78 
 
 		 1262 aa  46.6  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  21.04 
 
 		 1016 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  21.04 
 
 		 1016 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.7 
 
 		 1823 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.14 
 
 		 924 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.96 
 
 		 1217 aa  46.2  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3114  WD-40 repeat protein  32.7 
 
 		 816 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122668  normal  0.0357376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  21.9 
 
 		 1229 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  23.45 
 
 		 1552 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.78 
 
 		 676 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0342  Pyrrolo-quinoline quinone  26.67 
 
 		 441 aa  45.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.333089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0384  WD-40 repeat-containing protein  22.7 
 
 		 423 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  27.13 
 
 		 1100 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  20.95 
 
 		 1188 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  21.12 
 
 		 1311 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  27.04 
 
 		 1183 aa  45.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  20.62 
 
 		 1164 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2346  WD40 repeat, subgroup  33.33 
 
 		 512 aa  45.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.881407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  26.97 
 
 		 1344 aa  44.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.6 
 
 		 434 aa  44.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01056  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12380)  27.34 
 
 		 373 aa  44.3  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.691814  decreased coverage  0.00696515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  24.8 
 
 		 589 aa  44.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  35.53 
 
 		 335 aa  44.7  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.38 
 
 		 692 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.06 
 
 		 1267 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  27.14 
 
 		 316 aa  43.9  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  26.49 
 
 		 461 aa  43.9  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.82 
 
 		 1856 aa  44.3  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>